Protein–RNA interactions for Protein: Q13901

C1D, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1DQ13901 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1DQ13901 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1DQ13901 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1DQ13901 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1DQ13901 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1DQ13901 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1DQ13901 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1DQ13901 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1DQ13901 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1DQ13901 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1DQ13901 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1DQ13901 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1DQ13901 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1DQ13901 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1DQ13901 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1DQ13901 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1DQ13901 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1DQ13901 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1DQ13901 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1DQ13901 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1DQ13901 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1DQ13901 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1DQ13901 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1DQ13901 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
C1DQ13901 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1DQ13901 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1DQ13901 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1DQ13901 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1DQ13901 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1DQ13901 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1DQ13901 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1DQ13901 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1DQ13901 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1DQ13901 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1DQ13901 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1DQ13901 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1DQ13901 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1DQ13901 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1DQ13901 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1DQ13901 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1DQ13901 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1DQ13901 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
C1DQ13901 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
C1DQ13901 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1DQ13901 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1DQ13901 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1DQ13901 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1DQ13901 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1DQ13901 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1DQ13901 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1DQ13901 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1DQ13901 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
C1DQ13901 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1DQ13901 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1DQ13901 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1DQ13901 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1DQ13901 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1DQ13901 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1DQ13901 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1DQ13901 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1DQ13901 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1DQ13901 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1DQ13901 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1DQ13901 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1DQ13901 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1DQ13901 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1DQ13901 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1DQ13901 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1DQ13901 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1DQ13901 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1DQ13901 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1DQ13901 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1DQ13901 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1DQ13901 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1DQ13901 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1DQ13901 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1DQ13901 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1DQ13901 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1DQ13901 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1DQ13901 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1DQ13901 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1DQ13901 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1DQ13901 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1DQ13901 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1DQ13901 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1DQ13901 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1DQ13901 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1DQ13901 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1DQ13901 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1DQ13901 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1DQ13901 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1DQ13901 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1DQ13901 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1DQ13901 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1DQ13901 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C1DQ13901 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
C1DQ13901 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1DQ13901 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1DQ13901 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1DQ13901 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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