Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX39BQ13838 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX39BQ13838 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX39BQ13838 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX39BQ13838 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX39BQ13838 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX39BQ13838 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX39BQ13838 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX39BQ13838 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX39BQ13838 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX39BQ13838 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX39BQ13838 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX39BQ13838 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX39BQ13838 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX39BQ13838 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX39BQ13838 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX39BQ13838 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX39BQ13838 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX39BQ13838 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX39BQ13838 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX39BQ13838 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX39BQ13838 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX39BQ13838 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX39BQ13838 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX39BQ13838 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX39BQ13838 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX39BQ13838 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX39BQ13838 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX39BQ13838 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX39BQ13838 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX39BQ13838 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX39BQ13838 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX39BQ13838 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX39BQ13838 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX39BQ13838 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX39BQ13838 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX39BQ13838 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX39BQ13838 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX39BQ13838 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX39BQ13838 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX39BQ13838 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX39BQ13838 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX39BQ13838 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX39BQ13838 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX39BQ13838 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX39BQ13838 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DDX39BQ13838 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
DDX39BQ13838 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DDX39BQ13838 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX39BQ13838 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX39BQ13838 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX39BQ13838 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX39BQ13838 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX39BQ13838 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX39BQ13838 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX39BQ13838 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX39BQ13838 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX39BQ13838 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX39BQ13838 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX39BQ13838 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX39BQ13838 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX39BQ13838 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX39BQ13838 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX39BQ13838 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX39BQ13838 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX39BQ13838 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX39BQ13838 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX39BQ13838 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX39BQ13838 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX39BQ13838 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX39BQ13838 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX39BQ13838 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX39BQ13838 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX39BQ13838 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX39BQ13838 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX39BQ13838 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX39BQ13838 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX39BQ13838 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX39BQ13838 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX39BQ13838 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX39BQ13838 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX39BQ13838 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX39BQ13838 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX39BQ13838 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX39BQ13838 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX39BQ13838 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX39BQ13838 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX39BQ13838 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX39BQ13838 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX39BQ13838 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX39BQ13838 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX39BQ13838 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX39BQ13838 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX39BQ13838 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
DDX39BQ13838 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX39BQ13838 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX39BQ13838 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX39BQ13838 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX39BQ13838 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX39BQ13838 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
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