Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOP3AQ13472 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOP3AQ13472 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOP3AQ13472 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOP3AQ13472 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOP3AQ13472 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOP3AQ13472 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOP3AQ13472 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOP3AQ13472 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOP3AQ13472 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOP3AQ13472 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TOP3AQ13472 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TOP3AQ13472 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOP3AQ13472 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TOP3AQ13472 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOP3AQ13472 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TOP3AQ13472 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOP3AQ13472 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOP3AQ13472 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOP3AQ13472 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOP3AQ13472 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TOP3AQ13472 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOP3AQ13472 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TOP3AQ13472 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TOP3AQ13472 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TOP3AQ13472 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TOP3AQ13472 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TOP3AQ13472 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TOP3AQ13472 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TOP3AQ13472 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TOP3AQ13472 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TOP3AQ13472 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TOP3AQ13472 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TOP3AQ13472 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TOP3AQ13472 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TOP3AQ13472 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TOP3AQ13472 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TOP3AQ13472 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TOP3AQ13472 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TOP3AQ13472 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TOP3AQ13472 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TOP3AQ13472 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TOP3AQ13472 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TOP3AQ13472 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TOP3AQ13472 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TOP3AQ13472 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TOP3AQ13472 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TOP3AQ13472 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TOP3AQ13472 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TOP3AQ13472 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TOP3AQ13472 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TOP3AQ13472 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TOP3AQ13472 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TOP3AQ13472 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TOP3AQ13472 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TOP3AQ13472 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TOP3AQ13472 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TOP3AQ13472 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TOP3AQ13472 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TOP3AQ13472 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TOP3AQ13472 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TOP3AQ13472 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TOP3AQ13472 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TOP3AQ13472 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TOP3AQ13472 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TOP3AQ13472 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TOP3AQ13472 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TOP3AQ13472 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TOP3AQ13472 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TOP3AQ13472 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TOP3AQ13472 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TOP3AQ13472 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TOP3AQ13472 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TOP3AQ13472 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TOP3AQ13472 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TOP3AQ13472 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TOP3AQ13472 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TOP3AQ13472 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TOP3AQ13472 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TOP3AQ13472 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TOP3AQ13472 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TOP3AQ13472 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TOP3AQ13472 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TOP3AQ13472 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TOP3AQ13472 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TOP3AQ13472 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TOP3AQ13472 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TOP3AQ13472 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TOP3AQ13472 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOP3AQ13472 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOP3AQ13472 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOP3AQ13472 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOP3AQ13472 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOP3AQ13472 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TOP3AQ13472 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TOP3AQ13472 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TOP3AQ13472 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TOP3AQ13472 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TOP3AQ13472 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TOP3AQ13472 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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