Protein–RNA interactions for Protein: Q13319

CDK5R2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R2Q13319 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK5R2Q13319 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK5R2Q13319 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK5R2Q13319 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK5R2Q13319 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK5R2Q13319 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK5R2Q13319 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK5R2Q13319 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK5R2Q13319 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK5R2Q13319 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK5R2Q13319 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK5R2Q13319 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK5R2Q13319 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CDK5R2Q13319 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK5R2Q13319 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK5R2Q13319 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK5R2Q13319 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK5R2Q13319 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK5R2Q13319 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK5R2Q13319 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK5R2Q13319 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK5R2Q13319 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK5R2Q13319 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK5R2Q13319 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK5R2Q13319 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK5R2Q13319 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK5R2Q13319 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK5R2Q13319 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK5R2Q13319 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK5R2Q13319 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK5R2Q13319 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK5R2Q13319 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK5R2Q13319 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK5R2Q13319 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK5R2Q13319 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK5R2Q13319 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK5R2Q13319 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK5R2Q13319 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK5R2Q13319 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK5R2Q13319 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK5R2Q13319 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK5R2Q13319 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK5R2Q13319 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK5R2Q13319 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK5R2Q13319 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK5R2Q13319 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK5R2Q13319 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK5R2Q13319 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK5R2Q13319 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK5R2Q13319 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK5R2Q13319 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK5R2Q13319 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK5R2Q13319 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK5R2Q13319 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK5R2Q13319 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK5R2Q13319 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK5R2Q13319 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK5R2Q13319 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK5R2Q13319 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CDK5R2Q13319 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK5R2Q13319 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK5R2Q13319 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK5R2Q13319 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK5R2Q13319 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK5R2Q13319 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK5R2Q13319 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK5R2Q13319 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK5R2Q13319 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK5R2Q13319 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK5R2Q13319 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK5R2Q13319 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK5R2Q13319 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK5R2Q13319 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK5R2Q13319 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK5R2Q13319 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK5R2Q13319 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK5R2Q13319 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK5R2Q13319 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK5R2Q13319 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK5R2Q13319 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK5R2Q13319 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK5R2Q13319 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK5R2Q13319 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK5R2Q13319 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK5R2Q13319 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK5R2Q13319 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK5R2Q13319 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK5R2Q13319 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK5R2Q13319 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK5R2Q13319 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK5R2Q13319 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK5R2Q13319 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK5R2Q13319 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK5R2Q13319 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK5R2Q13319 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK5R2Q13319 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK5R2Q13319 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK5R2Q13319 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK5R2Q13319 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK5R2Q13319 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms