Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATMQ13315 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATMQ13315 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATMQ13315 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATMQ13315 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATMQ13315 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATMQ13315 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ATMQ13315 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATMQ13315 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATMQ13315 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATMQ13315 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATMQ13315 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATMQ13315 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATMQ13315 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATMQ13315 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATMQ13315 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATMQ13315 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATMQ13315 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATMQ13315 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATMQ13315 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATMQ13315 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATMQ13315 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATMQ13315 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATMQ13315 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATMQ13315 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATMQ13315 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATMQ13315 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATMQ13315 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATMQ13315 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATMQ13315 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATMQ13315 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATMQ13315 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATMQ13315 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATMQ13315 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATMQ13315 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATMQ13315 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATMQ13315 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATMQ13315 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATMQ13315 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATMQ13315 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATMQ13315 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATMQ13315 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATMQ13315 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATMQ13315 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATMQ13315 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATMQ13315 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATMQ13315 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ATMQ13315 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATMQ13315 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATMQ13315 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATMQ13315 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATMQ13315 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATMQ13315 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATMQ13315 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATMQ13315 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATMQ13315 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATMQ13315 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATMQ13315 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATMQ13315 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATMQ13315 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATMQ13315 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATMQ13315 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATMQ13315 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATMQ13315 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATMQ13315 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATMQ13315 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATMQ13315 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATMQ13315 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ATMQ13315 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATMQ13315 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATMQ13315 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATMQ13315 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATMQ13315 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATMQ13315 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATMQ13315 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATMQ13315 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATMQ13315 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATMQ13315 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATMQ13315 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATMQ13315 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATMQ13315 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ATMQ13315 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATMQ13315 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATMQ13315 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATMQ13315 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATMQ13315 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATMQ13315 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATMQ13315 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATMQ13315 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ATMQ13315 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATMQ13315 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATMQ13315 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATMQ13315 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATMQ13315 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATMQ13315 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATMQ13315 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATMQ13315 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATMQ13315 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ATMQ13315 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATMQ13315 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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