Protein–RNA interactions for Protein: Q13285

NR5A1, Steroidogenic factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR5A1Q13285 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NR5A1Q13285 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NR5A1Q13285 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
NR5A1Q13285 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
NR5A1Q13285 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
NR5A1Q13285 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NR5A1Q13285 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NR5A1Q13285 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NR5A1Q13285 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NR5A1Q13285 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NR5A1Q13285 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NR5A1Q13285 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NR5A1Q13285 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NR5A1Q13285 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NR5A1Q13285 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NR5A1Q13285 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NR5A1Q13285 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NR5A1Q13285 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NR5A1Q13285 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NR5A1Q13285 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NR5A1Q13285 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NR5A1Q13285 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NR5A1Q13285 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NR5A1Q13285 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NR5A1Q13285 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NR5A1Q13285 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NR5A1Q13285 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NR5A1Q13285 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NR5A1Q13285 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NR5A1Q13285 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NR5A1Q13285 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NR5A1Q13285 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NR5A1Q13285 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NR5A1Q13285 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NR5A1Q13285 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NR5A1Q13285 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NR5A1Q13285 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NR5A1Q13285 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NR5A1Q13285 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NR5A1Q13285 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NR5A1Q13285 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NR5A1Q13285 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NR5A1Q13285 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NR5A1Q13285 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NR5A1Q13285 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NR5A1Q13285 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NR5A1Q13285 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NR5A1Q13285 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NR5A1Q13285 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NR5A1Q13285 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NR5A1Q13285 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NR5A1Q13285 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NR5A1Q13285 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NR5A1Q13285 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NR5A1Q13285 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NR5A1Q13285 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NR5A1Q13285 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NR5A1Q13285 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NR5A1Q13285 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NR5A1Q13285 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NR5A1Q13285 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NR5A1Q13285 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NR5A1Q13285 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NR5A1Q13285 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NR5A1Q13285 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NR5A1Q13285 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NR5A1Q13285 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NR5A1Q13285 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NR5A1Q13285 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NR5A1Q13285 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NR5A1Q13285 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NR5A1Q13285 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NR5A1Q13285 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NR5A1Q13285 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NR5A1Q13285 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NR5A1Q13285 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NR5A1Q13285 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NR5A1Q13285 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NR5A1Q13285 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NR5A1Q13285 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NR5A1Q13285 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NR5A1Q13285 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NR5A1Q13285 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NR5A1Q13285 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NR5A1Q13285 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NR5A1Q13285 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NR5A1Q13285 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NR5A1Q13285 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NR5A1Q13285 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NR5A1Q13285 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NR5A1Q13285 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NR5A1Q13285 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NR5A1Q13285 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NR5A1Q13285 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NR5A1Q13285 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NR5A1Q13285 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NR5A1Q13285 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NR5A1Q13285 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NR5A1Q13285 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NR5A1Q13285 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms