Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NME3Q13232 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NME3Q13232 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NME3Q13232 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NME3Q13232 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NME3Q13232 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NME3Q13232 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NME3Q13232 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NME3Q13232 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NME3Q13232 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NME3Q13232 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NME3Q13232 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NME3Q13232 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NME3Q13232 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NME3Q13232 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NME3Q13232 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NME3Q13232 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NME3Q13232 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NME3Q13232 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NME3Q13232 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NME3Q13232 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NME3Q13232 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NME3Q13232 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NME3Q13232 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NME3Q13232 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NME3Q13232 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NME3Q13232 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NME3Q13232 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NME3Q13232 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NME3Q13232 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NME3Q13232 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NME3Q13232 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NME3Q13232 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NME3Q13232 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NME3Q13232 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NME3Q13232 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NME3Q13232 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NME3Q13232 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NME3Q13232 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NME3Q13232 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NME3Q13232 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NME3Q13232 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NME3Q13232 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NME3Q13232 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NME3Q13232 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NME3Q13232 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NME3Q13232 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NME3Q13232 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NME3Q13232 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NME3Q13232 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NME3Q13232 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NME3Q13232 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NME3Q13232 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NME3Q13232 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NME3Q13232 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NME3Q13232 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NME3Q13232 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NME3Q13232 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NME3Q13232 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NME3Q13232 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NME3Q13232 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NME3Q13232 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NME3Q13232 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NME3Q13232 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NME3Q13232 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NME3Q13232 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NME3Q13232 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NME3Q13232 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NME3Q13232 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NME3Q13232 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NME3Q13232 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NME3Q13232 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NME3Q13232 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NME3Q13232 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NME3Q13232 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NME3Q13232 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NME3Q13232 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NME3Q13232 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NME3Q13232 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NME3Q13232 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NME3Q13232 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NME3Q13232 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NME3Q13232 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NME3Q13232 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NME3Q13232 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NME3Q13232 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NME3Q13232 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NME3Q13232 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NME3Q13232 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NME3Q13232 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NME3Q13232 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NME3Q13232 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NME3Q13232 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NME3Q13232 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NME3Q13232 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NME3Q13232 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NME3Q13232 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NME3Q13232 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NME3Q13232 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NME3Q13232 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
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