Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SEMA3BQ13214 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA3BQ13214 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA3BQ13214 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA3BQ13214 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA3BQ13214 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA3BQ13214 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA3BQ13214 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA3BQ13214 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA3BQ13214 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA3BQ13214 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA3BQ13214 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA3BQ13214 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA3BQ13214 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA3BQ13214 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA3BQ13214 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA3BQ13214 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA3BQ13214 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA3BQ13214 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA3BQ13214 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEMA3BQ13214 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEMA3BQ13214 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEMA3BQ13214 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA3BQ13214 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA3BQ13214 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA3BQ13214 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA3BQ13214 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA3BQ13214 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA3BQ13214 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA3BQ13214 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA3BQ13214 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA3BQ13214 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA3BQ13214 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA3BQ13214 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA3BQ13214 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA3BQ13214 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA3BQ13214 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA3BQ13214 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA3BQ13214 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA3BQ13214 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA3BQ13214 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA3BQ13214 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA3BQ13214 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SEMA3BQ13214 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SEMA3BQ13214 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SEMA3BQ13214 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA3BQ13214 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA3BQ13214 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA3BQ13214 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA3BQ13214 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA3BQ13214 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA3BQ13214 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA3BQ13214 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA3BQ13214 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA3BQ13214 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA3BQ13214 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA3BQ13214 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA3BQ13214 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA3BQ13214 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA3BQ13214 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA3BQ13214 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA3BQ13214 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA3BQ13214 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA3BQ13214 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA3BQ13214 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA3BQ13214 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA3BQ13214 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA3BQ13214 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA3BQ13214 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA3BQ13214 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA3BQ13214 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA3BQ13214 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA3BQ13214 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA3BQ13214 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA3BQ13214 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA3BQ13214 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA3BQ13214 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA3BQ13214 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA3BQ13214 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA3BQ13214 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA3BQ13214 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA3BQ13214 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA3BQ13214 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA3BQ13214 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA3BQ13214 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA3BQ13214 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA3BQ13214 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA3BQ13214 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA3BQ13214 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA3BQ13214 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA3BQ13214 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA3BQ13214 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA3BQ13214 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA3BQ13214 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA3BQ13214 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA3BQ13214 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA3BQ13214 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA3BQ13214 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA3BQ13214 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA3BQ13214 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
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