Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHAF1AQ13111 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHAF1AQ13111 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHAF1AQ13111 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHAF1AQ13111 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHAF1AQ13111 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHAF1AQ13111 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CHAF1AQ13111 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CHAF1AQ13111 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CHAF1AQ13111 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CHAF1AQ13111 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHAF1AQ13111 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHAF1AQ13111 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHAF1AQ13111 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHAF1AQ13111 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CHAF1AQ13111 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHAF1AQ13111 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHAF1AQ13111 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHAF1AQ13111 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHAF1AQ13111 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHAF1AQ13111 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHAF1AQ13111 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHAF1AQ13111 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHAF1AQ13111 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHAF1AQ13111 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHAF1AQ13111 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHAF1AQ13111 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHAF1AQ13111 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHAF1AQ13111 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CHAF1AQ13111 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHAF1AQ13111 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHAF1AQ13111 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHAF1AQ13111 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHAF1AQ13111 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHAF1AQ13111 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CHAF1AQ13111 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHAF1AQ13111 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHAF1AQ13111 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHAF1AQ13111 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CHAF1AQ13111 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHAF1AQ13111 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHAF1AQ13111 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHAF1AQ13111 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHAF1AQ13111 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHAF1AQ13111 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CHAF1AQ13111 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CHAF1AQ13111 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHAF1AQ13111 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHAF1AQ13111 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHAF1AQ13111 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHAF1AQ13111 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHAF1AQ13111 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CHAF1AQ13111 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CHAF1AQ13111 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CHAF1AQ13111 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CHAF1AQ13111 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CHAF1AQ13111 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CHAF1AQ13111 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CHAF1AQ13111 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CHAF1AQ13111 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CHAF1AQ13111 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHAF1AQ13111 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHAF1AQ13111 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CHAF1AQ13111 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CHAF1AQ13111 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHAF1AQ13111 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHAF1AQ13111 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHAF1AQ13111 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHAF1AQ13111 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHAF1AQ13111 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CHAF1AQ13111 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CHAF1AQ13111 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHAF1AQ13111 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHAF1AQ13111 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHAF1AQ13111 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHAF1AQ13111 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHAF1AQ13111 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHAF1AQ13111 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHAF1AQ13111 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHAF1AQ13111 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHAF1AQ13111 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHAF1AQ13111 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHAF1AQ13111 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHAF1AQ13111 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CHAF1AQ13111 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHAF1AQ13111 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHAF1AQ13111 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CHAF1AQ13111 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CHAF1AQ13111 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CHAF1AQ13111 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CHAF1AQ13111 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHAF1AQ13111 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHAF1AQ13111 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHAF1AQ13111 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHAF1AQ13111 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHAF1AQ13111 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHAF1AQ13111 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHAF1AQ13111 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHAF1AQ13111 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CHAF1AQ13111 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms