Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
TROQ12816 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
TROQ12816 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
TROQ12816 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
TROQ12816 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
TROQ12816 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
TROQ12816 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
TROQ12816 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
TROQ12816 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
TROQ12816 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
TROQ12816 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
TROQ12816 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
TROQ12816 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
TROQ12816 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
TROQ12816 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
TROQ12816 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
TROQ12816 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
TROQ12816 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC37.03■■■■□ 3.52
TROQ12816 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
TROQ12816 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
TROQ12816 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
TROQ12816 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
TROQ12816 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
TROQ12816 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
TROQ12816 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
TROQ12816 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
TROQ12816 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
TROQ12816 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC37.02■■■■□ 3.52
TROQ12816 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
TROQ12816 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
TROQ12816 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
TROQ12816 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.51
TROQ12816 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
TROQ12816 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC37.01■■■■□ 3.51
TROQ12816 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC37.01■■■■□ 3.51
TROQ12816 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC37.01■■■■□ 3.51
TROQ12816 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC37.01■■■■□ 3.51
TROQ12816 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC37.01■■■■□ 3.51
TROQ12816 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
TROQ12816 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC37■■■■□ 3.51
TROQ12816 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
TROQ12816 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
TROQ12816 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
TROQ12816 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
TROQ12816 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
TROQ12816 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
TROQ12816 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC36.98■■■■□ 3.51
TROQ12816 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
TROQ12816 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
TROQ12816 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
TROQ12816 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC36.98■■■■□ 3.51
TROQ12816 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
TROQ12816 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
TROQ12816 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
TROQ12816 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
TROQ12816 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
TROQ12816 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
TROQ12816 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
TROQ12816 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
TROQ12816 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
TROQ12816 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
TROQ12816 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
TROQ12816 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
TROQ12816 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
TROQ12816 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
TROQ12816 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
TROQ12816 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
TROQ12816 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
TROQ12816 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
TROQ12816 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
TROQ12816 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
TROQ12816 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
TROQ12816 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
TROQ12816 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
TROQ12816 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
TROQ12816 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
TROQ12816 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
TROQ12816 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC36.93■■■■□ 3.5
TROQ12816 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC36.93■■■■□ 3.5
TROQ12816 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
TROQ12816 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
TROQ12816 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
TROQ12816 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
TROQ12816 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
TROQ12816 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
TROQ12816 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
TROQ12816 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
TROQ12816 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
TROQ12816 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
TROQ12816 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
TROQ12816 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
TROQ12816 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
TROQ12816 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
TROQ12816 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
TROQ12816 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
TROQ12816 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
TROQ12816 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
TROQ12816 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
TROQ12816 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
TROQ12816 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
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