Protein–RNA interactions for Protein: Q12483

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, yeastyeast

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNF8Q12483 ZRT2YLR130C 1269 nt5.57□□□□□ -1.52
SNF8Q12483 RDL2YOR286W 450 nt5.57□□□□□ -1.52
SNF8Q12483 PRI2YKL045W 1587 nt5.57□□□□□ -1.52
SNF8Q12483 HAS1YMR290C 1518 nt5.57□□□□□ -1.52
SNF8Q12483 SKN1YGR143W 2316 nt5.56□□□□□ -1.52
SNF8Q12483 YDL057WYDL057W 987 nt5.56□□□□□ -1.52
SNF8Q12483 YER186CYER186C 921 nt5.56□□□□□ -1.52
SNF8Q12483 KSS1YGR040W 1107 nt5.56□□□□□ -1.52
SNF8Q12483 LYS12YIL094C 1116 nt5.56□□□□□ -1.52
SNF8Q12483 MOG1YJR074W 657 nt5.56□□□□□ -1.52
SNF8Q12483 YOL131WYOL131W 327 nt5.56□□□□□ -1.52
SNF8Q12483 TFB4YPR056W 1017 nt5.56□□□□□ -1.52
SNF8Q12483 ASN1YPR145W 1719 nt5.56□□□□□ -1.52
SNF8Q12483 YRF1-4YLR466W 4149 nt5.56□□□□□ -1.52
SNF8Q12483 KEL1YHR158C 3495 nt5.55□□□□□ -1.52
SNF8Q12483 MTC5YDR128W 3447 nt5.55□□□□□ -1.52
SNF8Q12483 YDL023CYDL023C 321 nt5.55□□□□□ -1.52
SNF8Q12483 ATO3YDR384C 828 nt5.55□□□□□ -1.52
SNF8Q12483 SEC20YDR498C 1152 nt5.55□□□□□ -1.52
SNF8Q12483 MRP51YPL118W 1035 nt5.55□□□□□ -1.52
SNF8Q12483 MRPS5YBR251W 924 nt5.55□□□□□ -1.52
SNF8Q12483 QDR3YBR043C 2070 nt5.55□□□□□ -1.52
SNF8Q12483 QNS1YHR074W 2145 nt5.54□□□□□ -1.52
SNF8Q12483 NPA3YJR072C 1158 nt5.54□□□□□ -1.52
SNF8Q12483 KTR5YNL029C 1569 nt5.54□□□□□ -1.52
SNF8Q12483 TEL2YGR099W 2067 nt5.53□□□□□ -1.52
SNF8Q12483 RMA1YKL132C 1293 nt5.53□□□□□ -1.52
SNF8Q12483 YBR144CYBR144C 315 nt5.53□□□□□ -1.52
SNF8Q12483 PTK2YJR059W 2457 nt5.53□□□□□ -1.52
SNF8Q12483 VRP1YLR337C 2454 nt5.53□□□□□ -1.52
SNF8Q12483 YDR387CYDR387C 1668 nt5.53□□□□□ -1.52
SNF8Q12483 AMA1YGR225W 1782 nt5.52□□□□□ -1.53
SNF8Q12483 LYS21YDL131W 1323 nt5.52□□□□□ -1.53
SNF8Q12483 FAF1YIL019W 1041 nt5.52□□□□□ -1.53
SNF8Q12483 POR2YIL114C 846 nt5.52□□□□□ -1.53
SNF8Q12483 GEP5YLR091W 882 nt5.52□□□□□ -1.53
SNF8Q12483 YML012C-AYML012C-A 378 nt5.52□□□□□ -1.53
SNF8Q12483 RPS9AYPL081W 594 nt5.52□□□□□ -1.53
SNF8Q12483 MLC2YPR188C 492 nt5.52□□□□□ -1.53
SNF8Q12483 MNS1YJR131W 1650 nt5.52□□□□□ -1.53
SNF8Q12483 SOH1YGL127C 384 nt5.51□□□□□ -1.53
SNF8Q12483 CHO1YER026C 831 nt5.5□□□□□ -1.53
SNF8Q12483 FAT3YKL187C 2253 nt5.5□□□□□ -1.53
SNF8Q12483 SRP101YDR292C 1866 nt5.49□□□□□ -1.53
SNF8Q12483 MID1YNL291C 1647 nt5.49□□□□□ -1.53
SNF8Q12483 GEX1YCL073C 1848 nt5.49□□□□□ -1.53
SNF8Q12483 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt5.49□□□□□ -1.53
SNF8Q12483 PRE3YJL001W 648 nt5.49□□□□□ -1.53
SNF8Q12483 RBD2YPL246C 789 nt5.49□□□□□ -1.53
SNF8Q12483 GPT2YKR067W 2232 nt5.49□□□□□ -1.53
SNF8Q12483 CHL4YDR254W 1377 nt5.49□□□□□ -1.53
SNF8Q12483 COR1YBL045C 1374 nt5.49□□□□□ -1.53
SNF8Q12483 SMF2YHR050W 1650 nt5.48□□□□□ -1.53
SNF8Q12483 SET5YHR207C 1581 nt5.48□□□□□ -1.53
SNF8Q12483 IDP1YDL066W 1287 nt5.48□□□□□ -1.53
SNF8Q12483 APS3YJL024C 585 nt5.48□□□□□ -1.53
SNF8Q12483 GFD1YMR255W 567 nt5.48□□□□□ -1.53
SNF8Q12483 DEF1YKL054C 2217 nt5.48□□□□□ -1.53
SNF8Q12483 GUP2YPL189W 1830 nt5.48□□□□□ -1.53
SNF8Q12483 YMR027WYMR027W 1413 nt5.48□□□□□ -1.53
SNF8Q12483 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt5.47□□□□□ -1.53
SNF8Q12483 ATG12YBR217W 561 nt5.47□□□□□ -1.53
SNF8Q12483 GLE1YDL207W 1617 nt5.47□□□□□ -1.53
SNF8Q12483 VNX1YNL321W 2727 nt5.46□□□□□ -1.53
SNF8Q12483 LSG1YGL099W 1923 nt5.46□□□□□ -1.53
SNF8Q12483 SSK1YLR006C 2139 nt5.46□□□□□ -1.54
SNF8Q12483 ECM19YLR390W 339 nt5.46□□□□□ -1.54
SNF8Q12483 ALD6YPL061W 1503 nt5.46□□□□□ -1.54
SNF8Q12483 CRZ1YNL027W 2037 nt5.46□□□□□ -1.54
SNF8Q12483 GYP1YOR070C 1914 nt5.46□□□□□ -1.54
SNF8Q12483 AAP1YHR047C 2571 nt5.46□□□□□ -1.54
SNF8Q12483 YER010CYER010C 705 nt5.45□□□□□ -1.54
SNF8Q12483 AAD15YOL165C 432 nt5.45□□□□□ -1.54
SNF8Q12483 RPO26YPR187W 468 nt5.45□□□□□ -1.54
SNF8Q12483 AMD1YML035C 2433 nt5.45□□□□□ -1.54
SNF8Q12483 GEX2YKR106W 1848 nt5.44□□□□□ -1.54
SNF8Q12483 ENT2YLR206W 1842 nt5.44□□□□□ -1.54
SNF8Q12483 SSK22YCR073C 3996 nt5.44□□□□□ -1.54
SNF8Q12483 YDL114WYDL114W 927 nt5.44□□□□□ -1.54
SNF8Q12483 YEA6YEL006W 1008 nt5.44□□□□□ -1.54
SNF8Q12483 SNZ3YFL059W 897 nt5.44□□□□□ -1.54
SNF8Q12483 RRP4YHR069C 1080 nt5.44□□□□□ -1.54
SNF8Q12483 HSP150YJL159W 1242 nt5.44□□□□□ -1.54
SNF8Q12483 YJL171CYJL171C 1191 nt5.44□□□□□ -1.54
SNF8Q12483 SNZ2YNL333W 897 nt5.44□□□□□ -1.54
SNF8Q12483 RET1YOR207C 3450 nt5.43□□□□□ -1.54
SNF8Q12483 PRS2YER099C 957 nt5.43□□□□□ -1.54
SNF8Q12483 YLR317WYLR317W 435 nt5.43□□□□□ -1.54
SNF8Q12483 YNL108CYNL108C 813 nt5.43□□□□□ -1.54
SNF8Q12483 PFA3YNL326C 1011 nt5.43□□□□□ -1.54
SNF8Q12483 ENV7YPL236C 1095 nt5.43□□□□□ -1.54
SNF8Q12483 UGX2YDL169C 672 nt5.42□□□□□ -1.54
SNF8Q12483 DFM1YDR411C 1026 nt5.42□□□□□ -1.54
SNF8Q12483 YGL072CYGL072C 360 nt5.42□□□□□ -1.54
SNF8Q12483 CSG2YBR036C 1233 nt5.42□□□□□ -1.54
SNF8Q12483 PRP46YPL151C 1356 nt5.42□□□□□ -1.54
SNF8Q12483 YME1YPR024W 2244 nt5.42□□□□□ -1.54
SNF8Q12483 BUL1YMR275C 2931 nt5.41□□□□□ -1.54
SNF8Q12483 HSF1YGL073W 2502 nt5.41□□□□□ -1.54
SNF8Q12483 STL1YDR536W 1710 nt5.41□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.1 ms