Protein–RNA interactions for Protein: Q12004

TFB4, General transcription and DNA repair factor IIH subunit TFB4, yeastyeast

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TFB4Q12004 EUG1YDR518W 1554 nt8.2□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 RRP43YCR035C 1185 nt8.2□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 CBF1YJR060W 1056 nt8.2□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 YKL169CYKL169C 384 nt8.2□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 YLL037WYLL037W 381 nt8.2□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 NSE1YLR007W 1011 nt8.2□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 NPT1YOR209C 1290 nt8.2□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 RPB8YOR224C 441 nt8.2□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 SPO19YPL130W 672 nt8.2□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 ENV7YPL236C 1095 nt8.2□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 ADH5YBR145W 1056 nt8.2□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 CSH1YBR161W 1131 nt8.2□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 ICL2YPR006C 1728 nt8.2□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 HOS1YPR068C 1413 nt8.2□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 KEL3YPL263C 1956 nt8.19□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 SPO74YGL170C 1242 nt8.19□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 PFS1YHR185C 714 nt8.19□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 NVJ1YHR195W 966 nt8.19□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 PRE3YJL001W 648 nt8.19□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 BAT2YJR148W 1131 nt8.19□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 YLR334CYLR334C 381 nt8.19□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 YNL017CYNL017C 339 nt8.19□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 SWT21YNL187W 1074 nt8.19□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 LSR1LSR1 1175 nt8.19□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 YOL035CYOL035C 303 nt8.19□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 PFK27YOL136C 1194 nt8.19□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 IRC11YOR013W 471 nt8.19□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 YPR012WYPR012W 255 nt8.19□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 DRS1YLL008W 2259 nt8.19□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 PTR2YKR093W 1806 nt8.19□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 ATG18YFR021W 1503 nt8.19□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 MSS2YDL107W 1056 nt8.18□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 YKR012CYKR012C 378 nt8.18□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 YML099W-AYML099W-A 330 nt8.18□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 SAS2YMR127C 1017 nt8.18□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 ECM13YBL043W 774 nt8.18□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 MED4YOR174W 855 nt8.18□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 YBR071WYBR071W 636 nt8.18□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 ENO1YGR254W 1314 nt8.18□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 RPD3YNL330C 1302 nt8.18□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 FDC1YDR539W 1512 nt8.18□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 BI3Q0115 1554 nt8.18□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 CRD1YDL142C 852 nt8.17□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 RNH202YDR279W 1053 nt8.17□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 RPB7YDR404C 516 nt8.17□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 SHO1YER118C 1104 nt8.17□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 IRC7YFR055W 1023 nt8.17□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 YRB2YIL063C 984 nt8.17□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 YJL215CYJL215C 360 nt8.17□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 MDM35YKL053C-A 261 nt8.17□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 TEF4YKL081W 1239 nt8.17□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 RNP1YLL046C 750 nt8.17□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 YLR280CYLR280C 351 nt8.17□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 YNL050CYNL050C 813 nt8.17□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 LTO1YNL260C 597 nt8.17□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 YPL034WYPL034W 498 nt8.17□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 COM2YER130C 1332 nt8.17□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 HMS1YOR032C 1305 nt8.17□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 GUT1YHL032C 2130 nt8.17□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 SPR28YDR218C 1272 nt8.16□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 RTR1YER139C 681 nt8.16□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 HXT10YFL011W 1641 nt8.16□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 NAM8YHR086W 1572 nt8.16□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 PPX1YHR201C 1194 nt8.16□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 YHR212W-AYHR212W-A 204 nt8.16□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 CKA1YIL035C 1119 nt8.16□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 RPL10YLR075W 666 nt8.16□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 YAR061WYAR061W 204 nt8.16□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt8.16□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 SML1YML058W 315 nt8.16□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 YOR343CYOR343C 327 nt8.16□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 PTC1YDL006W 846 nt8.15□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 SLU7YDR088C 1149 nt8.15□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 PFA5YDR459C 1125 nt8.15□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 YGR015CYGR015C 987 nt8.15□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 YGR273CYGR273C 525 nt8.15□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 MAC1YMR021C 1254 nt8.15□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 NOP13YNL175C 1212 nt8.15□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 YOR300WYOR300W 309 nt8.15□□□□□ -1.1
TFB4Q12004 IES1YFL013C 2079 nt8.15□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 AVT2YEL064C 1443 nt8.14□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 GUS1YGL245W 2127 nt8.14□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 YRF1-3YGR296W 5580 nt8.14□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 YRF1-6YNL339C 5580 nt8.14□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 YRF1-7YPL283C 5580 nt8.14□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 MSS116YDR194C 1995 nt8.14□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 RAD59YDL059C 717 nt8.14□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 SNU23YDL098C 585 nt8.14□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 RPL12BYDR418W 498 nt8.14□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 RRP46YGR095C 672 nt8.14□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 YGR114CYGR114C 390 nt8.14□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 YGR210CYGR210C 1236 nt8.14□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 YJL068CYJL068C 900 nt8.14□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 CWP2YKL096W-A 279 nt8.14□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 REX2YLR059C 810 nt8.14□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 HEK2YBL032W 1146 nt8.14□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 AIF1YNR074C 1137 nt8.14□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 MDY2YOL111C 639 nt8.14□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 HUA2YOR284W 732 nt8.14□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 PNG1YPL096W 1092 nt8.14□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 30.9 ms