Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD47Q08722 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD47Q08722 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD47Q08722 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD47Q08722 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CD47Q08722 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CD47Q08722 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD47Q08722 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD47Q08722 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD47Q08722 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD47Q08722 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD47Q08722 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD47Q08722 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD47Q08722 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD47Q08722 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD47Q08722 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD47Q08722 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD47Q08722 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD47Q08722 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD47Q08722 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD47Q08722 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD47Q08722 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD47Q08722 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD47Q08722 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD47Q08722 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD47Q08722 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD47Q08722 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD47Q08722 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD47Q08722 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD47Q08722 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD47Q08722 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD47Q08722 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD47Q08722 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD47Q08722 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD47Q08722 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD47Q08722 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CD47Q08722 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD47Q08722 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD47Q08722 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD47Q08722 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD47Q08722 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD47Q08722 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD47Q08722 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD47Q08722 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD47Q08722 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD47Q08722 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CD47Q08722 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CD47Q08722 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CD47Q08722 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CD47Q08722 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CD47Q08722 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CD47Q08722 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CD47Q08722 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CD47Q08722 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CD47Q08722 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD47Q08722 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD47Q08722 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD47Q08722 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD47Q08722 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD47Q08722 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD47Q08722 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD47Q08722 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD47Q08722 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD47Q08722 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD47Q08722 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD47Q08722 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD47Q08722 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD47Q08722 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD47Q08722 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD47Q08722 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CD47Q08722 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD47Q08722 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD47Q08722 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD47Q08722 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD47Q08722 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD47Q08722 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD47Q08722 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD47Q08722 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD47Q08722 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD47Q08722 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD47Q08722 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD47Q08722 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD47Q08722 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD47Q08722 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD47Q08722 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD47Q08722 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD47Q08722 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD47Q08722 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD47Q08722 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD47Q08722 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD47Q08722 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD47Q08722 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD47Q08722 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD47Q08722 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD47Q08722 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD47Q08722 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD47Q08722 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD47Q08722 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD47Q08722 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD47Q08722 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms