Protein–RNA interactions for Protein: Q08235

BRX1, Ribosome biogenesis protein BRX1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRX1Q08235 CYK3YDL117W 2658 nt5.56□□□□□ -1.52
BRX1Q08235 YDR015CYDR015C 240 nt5.56□□□□□ -1.52
BRX1Q08235 FYV1YDR024W 486 nt5.56□□□□□ -1.52
BRX1Q08235 BCY1YIL033C 1251 nt5.56□□□□□ -1.52
BRX1Q08235 DAP1YPL170W 459 nt5.56□□□□□ -1.52
BRX1Q08235 RRT2YBR246W 1164 nt5.56□□□□□ -1.52
BRX1Q08235 BUD9YGR041W 1644 nt5.56□□□□□ -1.52
BRX1Q08235 DFG5YMR238W 1377 nt5.55□□□□□ -1.52
BRX1Q08235 YHR213W-AYHR213W-A 234 nt5.55□□□□□ -1.52
BRX1Q08235 IMD1YAR073W 1212 nt5.55□□□□□ -1.52
BRX1Q08235 TSA1YML028W 591 nt5.55□□□□□ -1.52
BRX1Q08235 YNL285WYNL285W 372 nt5.55□□□□□ -1.52
BRX1Q08235 FSF1YOR271C 984 nt5.55□□□□□ -1.52
BRX1Q08235 MRPS16YPL013C 366 nt5.55□□□□□ -1.52
BRX1Q08235 ICL1YER065C 1674 nt5.54□□□□□ -1.52
BRX1Q08235 GUD1YDL238C 1470 nt5.54□□□□□ -1.52
BRX1Q08235 CDC34YDR054C 888 nt5.54□□□□□ -1.52
BRX1Q08235 CAF40YNL288W 1122 nt5.54□□□□□ -1.52
BRX1Q08235 PFK2YMR205C 2880 nt5.54□□□□□ -1.52
BRX1Q08235 MDM31YHR194W 1740 nt5.54□□□□□ -1.52
BRX1Q08235 HST3YOR025W 1344 nt5.53□□□□□ -1.52
BRX1Q08235 PET112YBL080C 1626 nt5.53□□□□□ -1.52
BRX1Q08235 YDL218WYDL218W 954 nt5.53□□□□□ -1.52
BRX1Q08235 RPT3YDR394W 1287 nt5.53□□□□□ -1.52
BRX1Q08235 YEL068CYEL068C 333 nt5.53□□□□□ -1.52
BRX1Q08235 YNL019CYNL019C 855 nt5.53□□□□□ -1.52
BRX1Q08235 YNL033WYNL033W 855 nt5.53□□□□□ -1.52
BRX1Q08235 BNA5YLR231C 1362 nt5.53□□□□□ -1.52
BRX1Q08235 TEP1YNL128W 1305 nt5.52□□□□□ -1.53
BRX1Q08235 VNX1YNL321W 2727 nt5.52□□□□□ -1.53
BRX1Q08235 PGK1YCR012W 1251 nt5.52□□□□□ -1.53
BRX1Q08235 YJL193WYJL193W 1209 nt5.52□□□□□ -1.53
BRX1Q08235 ARA2YMR041C 1008 nt5.52□□□□□ -1.53
BRX1Q08235 SFB3YHR098C 2790 nt5.52□□□□□ -1.53
BRX1Q08235 YHL017WYHL017W 1599 nt5.51□□□□□ -1.53
BRX1Q08235 PIF1YML061C 2580 nt5.51□□□□□ -1.53
BRX1Q08235 KKQ8YKL168C 2175 nt5.51□□□□□ -1.53
BRX1Q08235 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt5.51□□□□□ -1.53
BRX1Q08235 YGL185CYGL185C 1140 nt5.51□□□□□ -1.53
BRX1Q08235 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt5.51□□□□□ -1.53
BRX1Q08235 JNM1YMR294W 1122 nt5.51□□□□□ -1.53
BRX1Q08235 YNL097W-AYNL097W-A 156 nt5.51□□□□□ -1.53
BRX1Q08235 ECM33YBR078W 1290 nt5.51□□□□□ -1.53
BRX1Q08235 YPR123CYPR123C 435 nt5.51□□□□□ -1.53
BRX1Q08235 ATE1YGL017W 1512 nt5.51□□□□□ -1.53
BRX1Q08235 IMA1YGR287C 1770 nt5.51□□□□□ -1.53
BRX1Q08235 TUL1YKL034W 2277 nt5.51□□□□□ -1.53
BRX1Q08235 TNA1YGR260W 1605 nt5.51□□□□□ -1.53
BRX1Q08235 EXO1YOR033C 2109 nt5.51□□□□□ -1.53
BRX1Q08235 DEF1YKL054C 2217 nt5.51□□□□□ -1.53
BRX1Q08235 MNN2YBR015C 1794 nt5.5□□□□□ -1.53
BRX1Q08235 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt5.5□□□□□ -1.53
BRX1Q08235 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt5.5□□□□□ -1.53
BRX1Q08235 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt5.5□□□□□ -1.53
BRX1Q08235 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt5.5□□□□□ -1.53
BRX1Q08235 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt5.5□□□□□ -1.53
BRX1Q08235 MRS1YIR021W 1092 nt5.5□□□□□ -1.53
BRX1Q08235 QRI5YLR204W 336 nt5.5□□□□□ -1.53
BRX1Q08235 YML083CYML083C 1257 nt5.5□□□□□ -1.53
BRX1Q08235 YHM2YMR241W 945 nt5.5□□□□□ -1.53
BRX1Q08235 YOL163WYOL163W 510 nt5.5□□□□□ -1.53
BRX1Q08235 CKA2YOR061W 1020 nt5.5□□□□□ -1.53
BRX1Q08235 GLN1YPR035W 1113 nt5.5□□□□□ -1.53
BRX1Q08235 YPR114WYPR114W 948 nt5.5□□□□□ -1.53
BRX1Q08235 PRP24YMR268C 1335 nt5.49□□□□□ -1.53
BRX1Q08235 SOG2YOR353C 2376 nt5.49□□□□□ -1.53
BRX1Q08235 GRX4YER174C 735 nt5.49□□□□□ -1.53
BRX1Q08235 DBP8YHR169W 1296 nt5.49□□□□□ -1.53
BRX1Q08235 YJR085CYJR085C 318 nt5.49□□□□□ -1.53
BRX1Q08235 IFA38YBR159W 1044 nt5.49□□□□□ -1.53
BRX1Q08235 ARN2YHL047C 1863 nt5.48□□□□□ -1.53
BRX1Q08235 MNN5YJL186W 1761 nt5.48□□□□□ -1.53
BRX1Q08235 RPR2YIR015W 435 nt5.48□□□□□ -1.53
BRX1Q08235 RPS5YJR123W 678 nt5.48□□□□□ -1.53
BRX1Q08235 ICT1YLR099C 1185 nt5.48□□□□□ -1.53
BRX1Q08235 HAP3YBL021C 435 nt5.48□□□□□ -1.53
BRX1Q08235 POR1YNL055C 852 nt5.48□□□□□ -1.53
BRX1Q08235 UBA2YDR390C 1911 nt5.47□□□□□ -1.53
BRX1Q08235 DOT5YIL010W 648 nt5.47□□□□□ -1.53
BRX1Q08235 FRS2YFL022C 1512 nt5.47□□□□□ -1.53
BRX1Q08235 YFL042CYFL042C 2025 nt5.47□□□□□ -1.53
BRX1Q08235 ERC1YHR032W 1746 nt5.46□□□□□ -1.54
BRX1Q08235 ATG7YHR171W 1893 nt5.46□□□□□ -1.54
BRX1Q08235 TRP1YDR007W 675 nt5.46□□□□□ -1.54
BRX1Q08235 CNE1YAL058W 1509 nt5.46□□□□□ -1.54
BRX1Q08235 RGT1YKL038W 3513 nt5.46□□□□□ -1.54
BRX1Q08235 ATG4YNL223W 1485 nt5.45□□□□□ -1.54
BRX1Q08235 ELP2YGR200C 2367 nt5.45□□□□□ -1.54
BRX1Q08235 DBF4YDR052C 2115 nt5.45□□□□□ -1.54
BRX1Q08235 YDL129WYDL129W 876 nt5.45□□□□□ -1.54
BRX1Q08235 SNZ3YFL059W 897 nt5.45□□□□□ -1.54
BRX1Q08235 PDE1YGL248W 1110 nt5.45□□□□□ -1.54
BRX1Q08235 EFM3YJR129C 1020 nt5.45□□□□□ -1.54
BRX1Q08235 YKL223WYKL223W 333 nt5.45□□□□□ -1.54
BRX1Q08235 SEC39YLR440C 2130 nt5.45□□□□□ -1.54
BRX1Q08235 DRS1YLL008W 2259 nt5.45□□□□□ -1.54
BRX1Q08235 VPS5YOR069W 2028 nt5.45□□□□□ -1.54
BRX1Q08235 MID1YNL291C 1647 nt5.45□□□□□ -1.54
BRX1Q08235 RAD24YER173W 1980 nt5.44□□□□□ -1.54
BRX1Q08235 SUP2tY(GUA)D 75 nt5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 9.6 ms