Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
ATP7AQ04656 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
ATP7AQ04656 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ATP7AQ04656 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
ATP7AQ04656 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
ATP7AQ04656 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
ATP7AQ04656 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
ATP7AQ04656 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
ATP7AQ04656 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
ATP7AQ04656 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
ATP7AQ04656 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
ATP7AQ04656 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
ATP7AQ04656 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
ATP7AQ04656 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
ATP7AQ04656 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
ATP7AQ04656 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
ATP7AQ04656 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
ATP7AQ04656 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
ATP7AQ04656 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
ATP7AQ04656 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
ATP7AQ04656 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
ATP7AQ04656 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
ATP7AQ04656 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
ATP7AQ04656 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
ATP7AQ04656 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
ATP7AQ04656 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC35.92■■■■□ 3.34
ATP7AQ04656 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
ATP7AQ04656 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
ATP7AQ04656 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
ATP7AQ04656 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
ATP7AQ04656 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
ATP7AQ04656 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
ATP7AQ04656 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
ATP7AQ04656 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
ATP7AQ04656 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
ATP7AQ04656 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
ATP7AQ04656 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
ATP7AQ04656 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
ATP7AQ04656 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
ATP7AQ04656 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
ATP7AQ04656 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
ATP7AQ04656 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
ATP7AQ04656 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
ATP7AQ04656 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
ATP7AQ04656 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
ATP7AQ04656 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
ATP7AQ04656 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
ATP7AQ04656 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
ATP7AQ04656 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
ATP7AQ04656 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
ATP7AQ04656 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
ATP7AQ04656 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
ATP7AQ04656 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
ATP7AQ04656 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
ATP7AQ04656 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
ATP7AQ04656 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
ATP7AQ04656 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
ATP7AQ04656 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
ATP7AQ04656 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
ATP7AQ04656 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ATP7AQ04656 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ATP7AQ04656 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ATP7AQ04656 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
ATP7AQ04656 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ATP7AQ04656 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
ATP7AQ04656 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.33
ATP7AQ04656 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.33
ATP7AQ04656 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
ATP7AQ04656 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
ATP7AQ04656 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
ATP7AQ04656 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
ATP7AQ04656 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
ATP7AQ04656 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
ATP7AQ04656 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
ATP7AQ04656 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
ATP7AQ04656 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
ATP7AQ04656 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
ATP7AQ04656 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
ATP7AQ04656 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
ATP7AQ04656 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
ATP7AQ04656 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
ATP7AQ04656 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
ATP7AQ04656 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
ATP7AQ04656 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
ATP7AQ04656 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
ATP7AQ04656 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
ATP7AQ04656 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
ATP7AQ04656 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
ATP7AQ04656 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
ATP7AQ04656 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
ATP7AQ04656 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
ATP7AQ04656 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
ATP7AQ04656 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
ATP7AQ04656 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
ATP7AQ04656 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
ATP7AQ04656 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
ATP7AQ04656 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
ATP7AQ04656 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
ATP7AQ04656 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
ATP7AQ04656 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC35.76■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms