Protein–RNA interactions for Protein: Q03252

LMNB2, Lamin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB2Q03252 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMNB2Q03252 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMNB2Q03252 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMNB2Q03252 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMNB2Q03252 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LMNB2Q03252 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMNB2Q03252 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LMNB2Q03252 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMNB2Q03252 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMNB2Q03252 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMNB2Q03252 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMNB2Q03252 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMNB2Q03252 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMNB2Q03252 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMNB2Q03252 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMNB2Q03252 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LMNB2Q03252 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMNB2Q03252 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMNB2Q03252 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMNB2Q03252 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMNB2Q03252 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMNB2Q03252 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMNB2Q03252 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMNB2Q03252 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LMNB2Q03252 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LMNB2Q03252 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMNB2Q03252 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMNB2Q03252 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMNB2Q03252 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMNB2Q03252 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMNB2Q03252 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMNB2Q03252 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMNB2Q03252 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMNB2Q03252 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMNB2Q03252 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMNB2Q03252 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMNB2Q03252 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMNB2Q03252 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMNB2Q03252 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMNB2Q03252 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMNB2Q03252 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMNB2Q03252 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMNB2Q03252 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMNB2Q03252 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LMNB2Q03252 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LMNB2Q03252 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMNB2Q03252 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMNB2Q03252 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMNB2Q03252 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LMNB2Q03252 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMNB2Q03252 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMNB2Q03252 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMNB2Q03252 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMNB2Q03252 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LMNB2Q03252 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMNB2Q03252 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMNB2Q03252 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMNB2Q03252 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMNB2Q03252 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMNB2Q03252 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMNB2Q03252 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMNB2Q03252 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LMNB2Q03252 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMNB2Q03252 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMNB2Q03252 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMNB2Q03252 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMNB2Q03252 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMNB2Q03252 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMNB2Q03252 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMNB2Q03252 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMNB2Q03252 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LMNB2Q03252 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMNB2Q03252 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMNB2Q03252 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMNB2Q03252 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMNB2Q03252 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMNB2Q03252 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMNB2Q03252 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMNB2Q03252 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMNB2Q03252 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMNB2Q03252 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMNB2Q03252 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMNB2Q03252 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMNB2Q03252 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMNB2Q03252 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LMNB2Q03252 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMNB2Q03252 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMNB2Q03252 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMNB2Q03252 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMNB2Q03252 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMNB2Q03252 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMNB2Q03252 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LMNB2Q03252 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMNB2Q03252 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMNB2Q03252 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMNB2Q03252 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMNB2Q03252 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMNB2Q03252 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMNB2Q03252 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMNB2Q03252 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms