Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
XPCQ01831 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
XPCQ01831 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
XPCQ01831 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
XPCQ01831 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
XPCQ01831 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
XPCQ01831 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
XPCQ01831 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
XPCQ01831 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
XPCQ01831 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
XPCQ01831 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
XPCQ01831 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
XPCQ01831 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
XPCQ01831 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
XPCQ01831 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
XPCQ01831 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
XPCQ01831 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
XPCQ01831 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
XPCQ01831 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
XPCQ01831 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC32.83■■■□□ 2.85
XPCQ01831 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
XPCQ01831 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
XPCQ01831 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
XPCQ01831 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
XPCQ01831 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
XPCQ01831 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
XPCQ01831 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
XPCQ01831 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
XPCQ01831 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
XPCQ01831 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
XPCQ01831 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
XPCQ01831 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
XPCQ01831 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
XPCQ01831 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
XPCQ01831 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
XPCQ01831 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
XPCQ01831 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
XPCQ01831 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
XPCQ01831 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
XPCQ01831 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
XPCQ01831 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
XPCQ01831 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
XPCQ01831 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
XPCQ01831 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
XPCQ01831 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
XPCQ01831 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
XPCQ01831 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
XPCQ01831 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
XPCQ01831 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
XPCQ01831 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
XPCQ01831 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
XPCQ01831 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
XPCQ01831 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
XPCQ01831 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
XPCQ01831 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
XPCQ01831 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
XPCQ01831 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
XPCQ01831 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
XPCQ01831 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
XPCQ01831 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
XPCQ01831 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
XPCQ01831 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
XPCQ01831 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
XPCQ01831 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
XPCQ01831 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
XPCQ01831 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
XPCQ01831 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
XPCQ01831 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
XPCQ01831 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
XPCQ01831 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
XPCQ01831 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
XPCQ01831 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
XPCQ01831 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
XPCQ01831 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
XPCQ01831 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
XPCQ01831 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
XPCQ01831 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
XPCQ01831 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
XPCQ01831 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
XPCQ01831 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
XPCQ01831 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
XPCQ01831 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
XPCQ01831 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
XPCQ01831 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
XPCQ01831 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
XPCQ01831 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
XPCQ01831 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
XPCQ01831 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
XPCQ01831 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
XPCQ01831 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
XPCQ01831 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
XPCQ01831 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
XPCQ01831 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
XPCQ01831 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
XPCQ01831 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
XPCQ01831 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
XPCQ01831 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
XPCQ01831 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
XPCQ01831 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
XPCQ01831 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms