Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA1BQ00975 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA1BQ00975 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1BQ00975 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1BQ00975 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1BQ00975 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1BQ00975 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1BQ00975 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1BQ00975 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1BQ00975 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1BQ00975 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1BQ00975 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA1BQ00975 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA1BQ00975 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA1BQ00975 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA1BQ00975 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA1BQ00975 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA1BQ00975 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA1BQ00975 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA1BQ00975 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA1BQ00975 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA1BQ00975 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA1BQ00975 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA1BQ00975 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA1BQ00975 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA1BQ00975 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA1BQ00975 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA1BQ00975 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA1BQ00975 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA1BQ00975 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA1BQ00975 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA1BQ00975 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA1BQ00975 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA1BQ00975 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA1BQ00975 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA1BQ00975 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA1BQ00975 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA1BQ00975 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA1BQ00975 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA1BQ00975 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA1BQ00975 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA1BQ00975 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA1BQ00975 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA1BQ00975 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA1BQ00975 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA1BQ00975 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1BQ00975 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1BQ00975 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1BQ00975 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1BQ00975 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1BQ00975 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1BQ00975 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1BQ00975 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1BQ00975 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1BQ00975 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1BQ00975 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA1BQ00975 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA1BQ00975 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA1BQ00975 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA1BQ00975 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA1BQ00975 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA1BQ00975 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA1BQ00975 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA1BQ00975 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA1BQ00975 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA1BQ00975 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA1BQ00975 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA1BQ00975 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA1BQ00975 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA1BQ00975 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA1BQ00975 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA1BQ00975 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA1BQ00975 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA1BQ00975 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA1BQ00975 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA1BQ00975 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA1BQ00975 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA1BQ00975 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA1BQ00975 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA1BQ00975 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA1BQ00975 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA1BQ00975 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA1BQ00975 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA1BQ00975 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA1BQ00975 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNA1BQ00975 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNA1BQ00975 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA1BQ00975 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA1BQ00975 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA1BQ00975 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA1BQ00975 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA1BQ00975 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA1BQ00975 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA1BQ00975 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA1BQ00975 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA1BQ00975 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA1BQ00975 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1BQ00975 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1BQ00975 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1BQ00975 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms