Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CBX1P83916 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CBX1P83916 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CBX1P83916 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CBX1P83916 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CBX1P83916 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CBX1P83916 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CBX1P83916 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CBX1P83916 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CBX1P83916 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CBX1P83916 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CBX1P83916 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CBX1P83916 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CBX1P83916 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CBX1P83916 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CBX1P83916 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CBX1P83916 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CBX1P83916 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CBX1P83916 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CBX1P83916 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CBX1P83916 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CBX1P83916 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CBX1P83916 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CBX1P83916 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CBX1P83916 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CBX1P83916 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CBX1P83916 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CBX1P83916 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CBX1P83916 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CBX1P83916 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CBX1P83916 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CBX1P83916 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CBX1P83916 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CBX1P83916 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CBX1P83916 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CBX1P83916 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CBX1P83916 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CBX1P83916 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CBX1P83916 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CBX1P83916 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CBX1P83916 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CBX1P83916 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CBX1P83916 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CBX1P83916 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CBX1P83916 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CBX1P83916 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CBX1P83916 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CBX1P83916 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CBX1P83916 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CBX1P83916 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CBX1P83916 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CBX1P83916 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CBX1P83916 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CBX1P83916 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CBX1P83916 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CBX1P83916 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CBX1P83916 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CBX1P83916 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CBX1P83916 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CBX1P83916 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CBX1P83916 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CBX1P83916 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CBX1P83916 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CBX1P83916 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CBX1P83916 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CBX1P83916 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CBX1P83916 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CBX1P83916 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CBX1P83916 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CBX1P83916 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CBX1P83916 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CBX1P83916 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CBX1P83916 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CBX1P83916 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CBX1P83916 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CBX1P83916 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CBX1P83916 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CBX1P83916 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CBX1P83916 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CBX1P83916 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CBX1P83916 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CBX1P83916 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CBX1P83916 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CBX1P83916 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CBX1P83916 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CBX1P83916 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CBX1P83916 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CBX1P83916 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CBX1P83916 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CBX1P83916 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CBX1P83916 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CBX1P83916 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CBX1P83916 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CBX1P83916 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CBX1P83916 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CBX1P83916 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CBX1P83916 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CBX1P83916 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CBX1P83916 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CBX1P83916 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms