Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
IRX3P78415 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IRX3P78415 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IRX3P78415 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IRX3P78415 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IRX3P78415 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IRX3P78415 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IRX3P78415 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IRX3P78415 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
IRX3P78415 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
IRX3P78415 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IRX3P78415 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
IRX3P78415 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
IRX3P78415 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
IRX3P78415 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
IRX3P78415 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
IRX3P78415 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
IRX3P78415 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
IRX3P78415 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
IRX3P78415 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
IRX3P78415 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
IRX3P78415 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
IRX3P78415 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
IRX3P78415 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
IRX3P78415 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
IRX3P78415 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
IRX3P78415 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
IRX3P78415 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
IRX3P78415 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IRX3P78415 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IRX3P78415 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IRX3P78415 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
IRX3P78415 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IRX3P78415 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IRX3P78415 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
IRX3P78415 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IRX3P78415 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IRX3P78415 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IRX3P78415 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IRX3P78415 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
IRX3P78415 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IRX3P78415 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IRX3P78415 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IRX3P78415 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IRX3P78415 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IRX3P78415 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
IRX3P78415 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
IRX3P78415 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IRX3P78415 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IRX3P78415 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IRX3P78415 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IRX3P78415 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IRX3P78415 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IRX3P78415 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IRX3P78415 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IRX3P78415 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
IRX3P78415 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IRX3P78415 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IRX3P78415 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IRX3P78415 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
IRX3P78415 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IRX3P78415 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IRX3P78415 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IRX3P78415 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IRX3P78415 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
IRX3P78415 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IRX3P78415 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.57■■■□□ 2
IRX3P78415 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
IRX3P78415 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IRX3P78415 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IRX3P78415 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IRX3P78415 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
IRX3P78415 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.55■■■□□ 2
IRX3P78415 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
IRX3P78415 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
IRX3P78415 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
IRX3P78415 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
IRX3P78415 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.55■■■□□ 2
IRX3P78415 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
IRX3P78415 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
IRX3P78415 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.55■■■□□ 2
IRX3P78415 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
IRX3P78415 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IRX3P78415 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IRX3P78415 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
IRX3P78415 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IRX3P78415 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.54■■■□□ 2
IRX3P78415 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IRX3P78415 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
IRX3P78415 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
IRX3P78415 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
IRX3P78415 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
IRX3P78415 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IRX3P78415 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
IRX3P78415 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IRX3P78415 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IRX3P78415 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.53■■■□□ 2
IRX3P78415 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.53■■■□□ 2
IRX3P78415 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.53■■■□□ 2
IRX3P78415 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.1 ms