Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOBP62745 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOBP62745 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOBP62745 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOBP62745 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOBP62745 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOBP62745 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOBP62745 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOBP62745 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOBP62745 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOBP62745 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOBP62745 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOBP62745 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOBP62745 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOBP62745 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOBP62745 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOBP62745 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RHOBP62745 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RHOBP62745 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RHOBP62745 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RHOBP62745 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
RHOBP62745 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHOBP62745 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHOBP62745 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOBP62745 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOBP62745 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOBP62745 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOBP62745 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOBP62745 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOBP62745 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOBP62745 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOBP62745 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOBP62745 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOBP62745 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOBP62745 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOBP62745 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOBP62745 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOBP62745 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOBP62745 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOBP62745 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOBP62745 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOBP62745 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOBP62745 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOBP62745 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOBP62745 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOBP62745 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOBP62745 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOBP62745 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOBP62745 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOBP62745 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOBP62745 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOBP62745 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOBP62745 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOBP62745 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOBP62745 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOBP62745 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOBP62745 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOBP62745 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOBP62745 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOBP62745 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOBP62745 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOBP62745 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOBP62745 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOBP62745 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOBP62745 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOBP62745 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOBP62745 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOBP62745 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOBP62745 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOBP62745 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOBP62745 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOBP62745 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOBP62745 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOBP62745 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOBP62745 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOBP62745 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOBP62745 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOBP62745 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOBP62745 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOBP62745 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RHOBP62745 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RHOBP62745 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RHOBP62745 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RHOBP62745 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOBP62745 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOBP62745 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOBP62745 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOBP62745 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOBP62745 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOBP62745 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOBP62745 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOBP62745 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOBP62745 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOBP62745 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOBP62745 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOBP62745 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOBP62745 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOBP62745 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOBP62745 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOBP62745 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms