Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOBP62745 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOBP62745 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOBP62745 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOBP62745 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOBP62745 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOBP62745 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOBP62745 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOBP62745 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOBP62745 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOBP62745 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOBP62745 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOBP62745 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOBP62745 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOBP62745 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOBP62745 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOBP62745 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RHOBP62745 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RHOBP62745 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RHOBP62745 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RHOBP62745 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
RHOBP62745 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHOBP62745 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHOBP62745 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOBP62745 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOBP62745 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOBP62745 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOBP62745 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOBP62745 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOBP62745 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOBP62745 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOBP62745 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOBP62745 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOBP62745 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOBP62745 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOBP62745 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOBP62745 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOBP62745 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOBP62745 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOBP62745 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOBP62745 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOBP62745 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOBP62745 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOBP62745 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOBP62745 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOBP62745 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOBP62745 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOBP62745 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOBP62745 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOBP62745 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOBP62745 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOBP62745 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOBP62745 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOBP62745 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOBP62745 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOBP62745 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOBP62745 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOBP62745 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOBP62745 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOBP62745 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOBP62745 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOBP62745 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOBP62745 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOBP62745 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOBP62745 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOBP62745 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOBP62745 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOBP62745 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOBP62745 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOBP62745 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOBP62745 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOBP62745 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOBP62745 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOBP62745 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOBP62745 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOBP62745 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOBP62745 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOBP62745 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOBP62745 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOBP62745 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RHOBP62745 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RHOBP62745 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RHOBP62745 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RHOBP62745 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOBP62745 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOBP62745 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOBP62745 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOBP62745 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOBP62745 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOBP62745 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOBP62745 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOBP62745 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOBP62745 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOBP62745 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOBP62745 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOBP62745 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOBP62745 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOBP62745 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOBP62745 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOBP62745 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms