Protein–RNA interactions for Protein: P61353

RPL27, 60S ribosomal protein L27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL27P61353 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL27P61353 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL27P61353 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL27P61353 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPL27P61353 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPL27P61353 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPL27P61353 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPL27P61353 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPL27P61353 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPL27P61353 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPL27P61353 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPL27P61353 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPL27P61353 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPL27P61353 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPL27P61353 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPL27P61353 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPL27P61353 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPL27P61353 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPL27P61353 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPL27P61353 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPL27P61353 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPL27P61353 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPL27P61353 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPL27P61353 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPL27P61353 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RPL27P61353 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPL27P61353 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPL27P61353 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPL27P61353 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPL27P61353 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPL27P61353 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPL27P61353 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPL27P61353 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPL27P61353 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPL27P61353 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPL27P61353 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPL27P61353 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RPL27P61353 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPL27P61353 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPL27P61353 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPL27P61353 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RPL27P61353 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPL27P61353 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPL27P61353 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPL27P61353 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPL27P61353 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPL27P61353 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPL27P61353 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RPL27P61353 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPL27P61353 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPL27P61353 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPL27P61353 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPL27P61353 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RPL27P61353 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RPL27P61353 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPL27P61353 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPL27P61353 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPL27P61353 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPL27P61353 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPL27P61353 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL27P61353 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL27P61353 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL27P61353 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL27P61353 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL27P61353 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL27P61353 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL27P61353 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL27P61353 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL27P61353 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL27P61353 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL27P61353 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL27P61353 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL27P61353 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL27P61353 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL27P61353 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL27P61353 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL27P61353 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL27P61353 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL27P61353 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL27P61353 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL27P61353 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL27P61353 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL27P61353 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL27P61353 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL27P61353 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL27P61353 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL27P61353 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL27P61353 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL27P61353 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL27P61353 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL27P61353 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL27P61353 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL27P61353 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL27P61353 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL27P61353 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL27P61353 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL27P61353 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL27P61353 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL27P61353 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL27P61353 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms