Protein–RNA interactions for Protein: P61289

PSME3, Proteasome activator complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3P61289 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSME3P61289 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSME3P61289 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSME3P61289 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSME3P61289 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PSME3P61289 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSME3P61289 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSME3P61289 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSME3P61289 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSME3P61289 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSME3P61289 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSME3P61289 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSME3P61289 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSME3P61289 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSME3P61289 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSME3P61289 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSME3P61289 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSME3P61289 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSME3P61289 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PSME3P61289 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PSME3P61289 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSME3P61289 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSME3P61289 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSME3P61289 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PSME3P61289 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSME3P61289 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSME3P61289 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSME3P61289 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSME3P61289 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSME3P61289 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSME3P61289 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSME3P61289 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSME3P61289 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSME3P61289 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSME3P61289 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSME3P61289 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSME3P61289 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSME3P61289 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSME3P61289 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSME3P61289 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSME3P61289 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSME3P61289 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSME3P61289 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSME3P61289 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PSME3P61289 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PSME3P61289 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSME3P61289 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSME3P61289 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSME3P61289 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSME3P61289 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSME3P61289 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSME3P61289 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSME3P61289 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSME3P61289 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSME3P61289 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSME3P61289 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSME3P61289 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSME3P61289 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSME3P61289 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSME3P61289 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSME3P61289 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PSME3P61289 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSME3P61289 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSME3P61289 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSME3P61289 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSME3P61289 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PSME3P61289 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSME3P61289 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSME3P61289 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSME3P61289 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSME3P61289 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSME3P61289 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSME3P61289 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSME3P61289 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSME3P61289 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSME3P61289 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSME3P61289 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSME3P61289 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSME3P61289 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSME3P61289 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSME3P61289 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSME3P61289 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSME3P61289 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSME3P61289 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSME3P61289 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSME3P61289 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSME3P61289 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSME3P61289 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSME3P61289 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSME3P61289 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSME3P61289 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSME3P61289 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PSME3P61289 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PSME3P61289 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PSME3P61289 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PSME3P61289 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PSME3P61289 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PSME3P61289 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PSME3P61289 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PSME3P61289 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms