Protein–RNA interactions for Protein: P61158

ACTR3, Actin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3P61158 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACTR3P61158 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACTR3P61158 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTR3P61158 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTR3P61158 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTR3P61158 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTR3P61158 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTR3P61158 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTR3P61158 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTR3P61158 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTR3P61158 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTR3P61158 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTR3P61158 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTR3P61158 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTR3P61158 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTR3P61158 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTR3P61158 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTR3P61158 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTR3P61158 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTR3P61158 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTR3P61158 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTR3P61158 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTR3P61158 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTR3P61158 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTR3P61158 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTR3P61158 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTR3P61158 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTR3P61158 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTR3P61158 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTR3P61158 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTR3P61158 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTR3P61158 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTR3P61158 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTR3P61158 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTR3P61158 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTR3P61158 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTR3P61158 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTR3P61158 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACTR3P61158 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACTR3P61158 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTR3P61158 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTR3P61158 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTR3P61158 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTR3P61158 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTR3P61158 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTR3P61158 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTR3P61158 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTR3P61158 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTR3P61158 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTR3P61158 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTR3P61158 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTR3P61158 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTR3P61158 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTR3P61158 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTR3P61158 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTR3P61158 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTR3P61158 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTR3P61158 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTR3P61158 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTR3P61158 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTR3P61158 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTR3P61158 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTR3P61158 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTR3P61158 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTR3P61158 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTR3P61158 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTR3P61158 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTR3P61158 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTR3P61158 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTR3P61158 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTR3P61158 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTR3P61158 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTR3P61158 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTR3P61158 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTR3P61158 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTR3P61158 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTR3P61158 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTR3P61158 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTR3P61158 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTR3P61158 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTR3P61158 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTR3P61158 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTR3P61158 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTR3P61158 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTR3P61158 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ACTR3P61158 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTR3P61158 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTR3P61158 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTR3P61158 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTR3P61158 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTR3P61158 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTR3P61158 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTR3P61158 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTR3P61158 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTR3P61158 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTR3P61158 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTR3P61158 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTR3P61158 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTR3P61158 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTR3P61158 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms