Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GJA9P57773 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GJA9P57773 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJA9P57773 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJA9P57773 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
GJA9P57773 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJA9P57773 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
GJA9P57773 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJA9P57773 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJA9P57773 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJA9P57773 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJA9P57773 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJA9P57773 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GJA9P57773 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJA9P57773 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJA9P57773 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GJA9P57773 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GJA9P57773 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GJA9P57773 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GJA9P57773 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GJA9P57773 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
GJA9P57773 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GJA9P57773 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
GJA9P57773 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
GJA9P57773 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
GJA9P57773 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
GJA9P57773 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GJA9P57773 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GJA9P57773 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GJA9P57773 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GJA9P57773 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GJA9P57773 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GJA9P57773 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GJA9P57773 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GJA9P57773 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GJA9P57773 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GJA9P57773 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GJA9P57773 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GJA9P57773 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GJA9P57773 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GJA9P57773 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GJA9P57773 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GJA9P57773 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
GJA9P57773 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GJA9P57773 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GJA9P57773 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GJA9P57773 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GJA9P57773 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GJA9P57773 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GJA9P57773 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GJA9P57773 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GJA9P57773 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GJA9P57773 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GJA9P57773 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GJA9P57773 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GJA9P57773 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
GJA9P57773 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GJA9P57773 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GJA9P57773 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GJA9P57773 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GJA9P57773 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GJA9P57773 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
GJA9P57773 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GJA9P57773 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GJA9P57773 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GJA9P57773 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GJA9P57773 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GJA9P57773 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GJA9P57773 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GJA9P57773 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GJA9P57773 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GJA9P57773 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJA9P57773 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJA9P57773 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJA9P57773 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJA9P57773 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJA9P57773 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJA9P57773 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJA9P57773 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJA9P57773 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GJA9P57773 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJA9P57773 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJA9P57773 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJA9P57773 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJA9P57773 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJA9P57773 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GJA9P57773 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJA9P57773 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GJA9P57773 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GJA9P57773 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GJA9P57773 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GJA9P57773 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GJA9P57773 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GJA9P57773 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GJA9P57773 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GJA9P57773 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GJA9P57773 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
GJA9P57773 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GJA9P57773 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GJA9P57773 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms