Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBASH3AP57075 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBASH3AP57075 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
UBASH3AP57075 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBASH3AP57075 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBASH3AP57075 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBASH3AP57075 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
UBASH3AP57075 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBASH3AP57075 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBASH3AP57075 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
UBASH3AP57075 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
UBASH3AP57075 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBASH3AP57075 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBASH3AP57075 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBASH3AP57075 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBASH3AP57075 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBASH3AP57075 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBASH3AP57075 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBASH3AP57075 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBASH3AP57075 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBASH3AP57075 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBASH3AP57075 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBASH3AP57075 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBASH3AP57075 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBASH3AP57075 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBASH3AP57075 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBASH3AP57075 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBASH3AP57075 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBASH3AP57075 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBASH3AP57075 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBASH3AP57075 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBASH3AP57075 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBASH3AP57075 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBASH3AP57075 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBASH3AP57075 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBASH3AP57075 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBASH3AP57075 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBASH3AP57075 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBASH3AP57075 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBASH3AP57075 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBASH3AP57075 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBASH3AP57075 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBASH3AP57075 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBASH3AP57075 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBASH3AP57075 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBASH3AP57075 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBASH3AP57075 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBASH3AP57075 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
UBASH3AP57075 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBASH3AP57075 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBASH3AP57075 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBASH3AP57075 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBASH3AP57075 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
UBASH3AP57075 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBASH3AP57075 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBASH3AP57075 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBASH3AP57075 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBASH3AP57075 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBASH3AP57075 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBASH3AP57075 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
UBASH3AP57075 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBASH3AP57075 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBASH3AP57075 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBASH3AP57075 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBASH3AP57075 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBASH3AP57075 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBASH3AP57075 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBASH3AP57075 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBASH3AP57075 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBASH3AP57075 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBASH3AP57075 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBASH3AP57075 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBASH3AP57075 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBASH3AP57075 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBASH3AP57075 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBASH3AP57075 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBASH3AP57075 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBASH3AP57075 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBASH3AP57075 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBASH3AP57075 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBASH3AP57075 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBASH3AP57075 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBASH3AP57075 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBASH3AP57075 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBASH3AP57075 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBASH3AP57075 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBASH3AP57075 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBASH3AP57075 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBASH3AP57075 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBASH3AP57075 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBASH3AP57075 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBASH3AP57075 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
UBASH3AP57075 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBASH3AP57075 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBASH3AP57075 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBASH3AP57075 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBASH3AP57075 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBASH3AP57075 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBASH3AP57075 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBASH3AP57075 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms