Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SOX10P56693 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SOX10P56693 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SOX10P56693 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SOX10P56693 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SOX10P56693 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SOX10P56693 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SOX10P56693 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SOX10P56693 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SOX10P56693 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SOX10P56693 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SOX10P56693 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SOX10P56693 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SOX10P56693 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SOX10P56693 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SOX10P56693 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SOX10P56693 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SOX10P56693 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SOX10P56693 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SOX10P56693 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SOX10P56693 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SOX10P56693 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SOX10P56693 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SOX10P56693 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SOX10P56693 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SOX10P56693 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SOX10P56693 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SOX10P56693 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SOX10P56693 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SOX10P56693 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SOX10P56693 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SOX10P56693 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SOX10P56693 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SOX10P56693 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SOX10P56693 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SOX10P56693 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SOX10P56693 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SOX10P56693 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SOX10P56693 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SOX10P56693 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SOX10P56693 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SOX10P56693 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SOX10P56693 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SOX10P56693 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SOX10P56693 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SOX10P56693 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SOX10P56693 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SOX10P56693 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SOX10P56693 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SOX10P56693 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SOX10P56693 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SOX10P56693 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SOX10P56693 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SOX10P56693 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SOX10P56693 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SOX10P56693 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SOX10P56693 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SOX10P56693 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SOX10P56693 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SOX10P56693 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SOX10P56693 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SOX10P56693 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SOX10P56693 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SOX10P56693 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SOX10P56693 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SOX10P56693 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SOX10P56693 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SOX10P56693 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SOX10P56693 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SOX10P56693 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SOX10P56693 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SOX10P56693 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SOX10P56693 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SOX10P56693 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SOX10P56693 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SOX10P56693 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SOX10P56693 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SOX10P56693 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SOX10P56693 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SOX10P56693 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SOX10P56693 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SOX10P56693 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SOX10P56693 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SOX10P56693 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SOX10P56693 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SOX10P56693 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SOX10P56693 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SOX10P56693 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SOX10P56693 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SOX10P56693 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SOX10P56693 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SOX10P56693 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SOX10P56693 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SOX10P56693 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SOX10P56693 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SOX10P56693 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SOX10P56693 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SOX10P56693 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SOX10P56693 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SOX10P56693 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms