Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUMO3P55854 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUMO3P55854 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUMO3P55854 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUMO3P55854 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SUMO3P55854 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUMO3P55854 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUMO3P55854 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUMO3P55854 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUMO3P55854 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUMO3P55854 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUMO3P55854 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SUMO3P55854 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SUMO3P55854 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SUMO3P55854 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SUMO3P55854 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SUMO3P55854 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SUMO3P55854 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SUMO3P55854 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SUMO3P55854 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SUMO3P55854 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SUMO3P55854 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SUMO3P55854 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SUMO3P55854 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SUMO3P55854 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SUMO3P55854 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SUMO3P55854 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SUMO3P55854 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SUMO3P55854 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SUMO3P55854 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SUMO3P55854 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SUMO3P55854 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SUMO3P55854 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SUMO3P55854 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SUMO3P55854 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SUMO3P55854 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SUMO3P55854 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SUMO3P55854 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SUMO3P55854 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SUMO3P55854 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SUMO3P55854 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SUMO3P55854 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SUMO3P55854 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SUMO3P55854 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SUMO3P55854 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SUMO3P55854 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SUMO3P55854 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SUMO3P55854 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SUMO3P55854 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SUMO3P55854 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SUMO3P55854 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SUMO3P55854 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SUMO3P55854 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SUMO3P55854 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SUMO3P55854 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SUMO3P55854 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SUMO3P55854 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUMO3P55854 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUMO3P55854 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUMO3P55854 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUMO3P55854 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUMO3P55854 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUMO3P55854 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUMO3P55854 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SUMO3P55854 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUMO3P55854 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUMO3P55854 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUMO3P55854 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUMO3P55854 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUMO3P55854 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUMO3P55854 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUMO3P55854 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUMO3P55854 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUMO3P55854 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUMO3P55854 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUMO3P55854 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUMO3P55854 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SUMO3P55854 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUMO3P55854 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SUMO3P55854 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUMO3P55854 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUMO3P55854 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUMO3P55854 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUMO3P55854 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUMO3P55854 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUMO3P55854 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUMO3P55854 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUMO3P55854 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUMO3P55854 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUMO3P55854 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUMO3P55854 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUMO3P55854 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUMO3P55854 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUMO3P55854 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SUMO3P55854 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUMO3P55854 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUMO3P55854 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SUMO3P55854 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUMO3P55854 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUMO3P55854 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms