Protein–RNA interactions for Protein: P55287

CDH11, Cadherin-11, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH11P55287 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH11P55287 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH11P55287 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH11P55287 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH11P55287 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH11P55287 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH11P55287 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH11P55287 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH11P55287 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH11P55287 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH11P55287 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH11P55287 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH11P55287 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH11P55287 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH11P55287 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH11P55287 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH11P55287 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH11P55287 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH11P55287 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH11P55287 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH11P55287 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH11P55287 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH11P55287 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH11P55287 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH11P55287 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH11P55287 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH11P55287 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH11P55287 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH11P55287 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH11P55287 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH11P55287 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH11P55287 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH11P55287 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH11P55287 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH11P55287 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH11P55287 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH11P55287 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH11P55287 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH11P55287 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH11P55287 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH11P55287 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH11P55287 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH11P55287 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH11P55287 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH11P55287 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH11P55287 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH11P55287 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH11P55287 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH11P55287 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH11P55287 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH11P55287 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDH11P55287 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDH11P55287 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDH11P55287 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDH11P55287 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDH11P55287 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDH11P55287 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDH11P55287 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDH11P55287 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDH11P55287 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CDH11P55287 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDH11P55287 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDH11P55287 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDH11P55287 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDH11P55287 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDH11P55287 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDH11P55287 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDH11P55287 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDH11P55287 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDH11P55287 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CDH11P55287 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDH11P55287 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDH11P55287 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDH11P55287 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CDH11P55287 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDH11P55287 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDH11P55287 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDH11P55287 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDH11P55287 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDH11P55287 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDH11P55287 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDH11P55287 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDH11P55287 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDH11P55287 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDH11P55287 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH11P55287 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH11P55287 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH11P55287 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH11P55287 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH11P55287 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH11P55287 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH11P55287 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH11P55287 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH11P55287 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH11P55287 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH11P55287 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH11P55287 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH11P55287 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH11P55287 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH11P55287 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms