Protein–RNA interactions for Protein: P55286

CDH8, Cadherin-8, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH8P55286 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDH8P55286 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDH8P55286 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDH8P55286 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDH8P55286 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDH8P55286 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDH8P55286 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDH8P55286 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDH8P55286 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDH8P55286 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDH8P55286 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDH8P55286 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDH8P55286 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDH8P55286 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDH8P55286 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDH8P55286 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDH8P55286 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDH8P55286 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDH8P55286 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDH8P55286 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDH8P55286 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDH8P55286 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CDH8P55286 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDH8P55286 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDH8P55286 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDH8P55286 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDH8P55286 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDH8P55286 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDH8P55286 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDH8P55286 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDH8P55286 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDH8P55286 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDH8P55286 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDH8P55286 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDH8P55286 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDH8P55286 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDH8P55286 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDH8P55286 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDH8P55286 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDH8P55286 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDH8P55286 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDH8P55286 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDH8P55286 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDH8P55286 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDH8P55286 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDH8P55286 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDH8P55286 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDH8P55286 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDH8P55286 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDH8P55286 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDH8P55286 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDH8P55286 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDH8P55286 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDH8P55286 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDH8P55286 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDH8P55286 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CDH8P55286 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDH8P55286 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDH8P55286 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDH8P55286 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CDH8P55286 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDH8P55286 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDH8P55286 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CDH8P55286 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDH8P55286 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDH8P55286 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDH8P55286 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDH8P55286 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDH8P55286 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDH8P55286 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDH8P55286 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDH8P55286 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CDH8P55286 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDH8P55286 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDH8P55286 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDH8P55286 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDH8P55286 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDH8P55286 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDH8P55286 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDH8P55286 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDH8P55286 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDH8P55286 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDH8P55286 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDH8P55286 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDH8P55286 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDH8P55286 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDH8P55286 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDH8P55286 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDH8P55286 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH8P55286 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH8P55286 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH8P55286 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH8P55286 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH8P55286 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH8P55286 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH8P55286 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH8P55286 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH8P55286 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH8P55286 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDH8P55286 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms