Protein–RNA interactions for Protein: P55055

NR1H2, Oxysterols receptor LXR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H2P55055 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR1H2P55055 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR1H2P55055 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NR1H2P55055 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR1H2P55055 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR1H2P55055 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NR1H2P55055 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR1H2P55055 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR1H2P55055 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR1H2P55055 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR1H2P55055 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR1H2P55055 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR1H2P55055 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
NR1H2P55055 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1H2P55055 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1H2P55055 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR1H2P55055 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR1H2P55055 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR1H2P55055 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR1H2P55055 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR1H2P55055 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR1H2P55055 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR1H2P55055 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR1H2P55055 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR1H2P55055 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR1H2P55055 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR1H2P55055 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR1H2P55055 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NR1H2P55055 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR1H2P55055 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR1H2P55055 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR1H2P55055 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR1H2P55055 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR1H2P55055 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR1H2P55055 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR1H2P55055 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR1H2P55055 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR1H2P55055 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR1H2P55055 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR1H2P55055 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR1H2P55055 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR1H2P55055 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR1H2P55055 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR1H2P55055 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR1H2P55055 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR1H2P55055 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR1H2P55055 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR1H2P55055 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR1H2P55055 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR1H2P55055 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR1H2P55055 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR1H2P55055 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR1H2P55055 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR1H2P55055 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR1H2P55055 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR1H2P55055 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR1H2P55055 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NR1H2P55055 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR1H2P55055 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR1H2P55055 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR1H2P55055 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NR1H2P55055 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR1H2P55055 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR1H2P55055 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR1H2P55055 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR1H2P55055 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR1H2P55055 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NR1H2P55055 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR1H2P55055 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR1H2P55055 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR1H2P55055 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR1H2P55055 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR1H2P55055 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR1H2P55055 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR1H2P55055 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR1H2P55055 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR1H2P55055 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NR1H2P55055 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR1H2P55055 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR1H2P55055 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR1H2P55055 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR1H2P55055 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR1H2P55055 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR1H2P55055 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR1H2P55055 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR1H2P55055 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NR1H2P55055 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR1H2P55055 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR1H2P55055 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR1H2P55055 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR1H2P55055 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR1H2P55055 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR1H2P55055 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR1H2P55055 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR1H2P55055 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR1H2P55055 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR1H2P55055 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR1H2P55055 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NR1H2P55055 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR1H2P55055 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms