Protein–RNA interactions for Protein: P54764

EPHA4, Ephrin type-A receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA4P54764 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHA4P54764 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHA4P54764 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHA4P54764 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHA4P54764 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHA4P54764 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHA4P54764 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHA4P54764 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHA4P54764 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHA4P54764 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHA4P54764 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHA4P54764 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHA4P54764 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHA4P54764 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHA4P54764 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPHA4P54764 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPHA4P54764 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
EPHA4P54764 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPHA4P54764 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHA4P54764 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHA4P54764 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHA4P54764 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHA4P54764 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHA4P54764 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHA4P54764 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHA4P54764 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPHA4P54764 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPHA4P54764 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPHA4P54764 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
EPHA4P54764 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPHA4P54764 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPHA4P54764 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHA4P54764 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHA4P54764 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHA4P54764 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHA4P54764 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHA4P54764 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHA4P54764 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHA4P54764 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHA4P54764 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHA4P54764 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHA4P54764 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHA4P54764 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHA4P54764 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHA4P54764 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHA4P54764 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHA4P54764 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHA4P54764 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHA4P54764 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHA4P54764 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHA4P54764 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHA4P54764 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHA4P54764 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EPHA4P54764 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPHA4P54764 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
EPHA4P54764 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPHA4P54764 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPHA4P54764 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPHA4P54764 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHA4P54764 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHA4P54764 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHA4P54764 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHA4P54764 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHA4P54764 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHA4P54764 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHA4P54764 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHA4P54764 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHA4P54764 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHA4P54764 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHA4P54764 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHA4P54764 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHA4P54764 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHA4P54764 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHA4P54764 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHA4P54764 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHA4P54764 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHA4P54764 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHA4P54764 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHA4P54764 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHA4P54764 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHA4P54764 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHA4P54764 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHA4P54764 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHA4P54764 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHA4P54764 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHA4P54764 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHA4P54764 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHA4P54764 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHA4P54764 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHA4P54764 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHA4P54764 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHA4P54764 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHA4P54764 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHA4P54764 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHA4P54764 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHA4P54764 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHA4P54764 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHA4P54764 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHA4P54764 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHA4P54764 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms