Protein–RNA interactions for Protein: P53847

DSL1, Protein transport protein DSL1, yeast

Predictions only

Length 754 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSL1	P53847	YLR122C	YLR122C	378 nt		5.87	□□□□□ -1.47
DSL1	P53847	YOL131W	YOL131W	327 nt		5.87	□□□□□ -1.47
DSL1	P53847	GUD1	YDL238C	1470 nt		5.87	□□□□□ -1.47
DSL1	P53847	RAD59	YDL059C	717 nt		5.86	□□□□□ -1.47
DSL1	P53847	AAT2	YLR027C	1257 nt		5.86	□□□□□ -1.47
DSL1	P53847	RPL10	YLR075W	666 nt		5.86	□□□□□ -1.47
DSL1	P53847	TSR2	YLR435W	618 nt		5.86	□□□□□ -1.47
DSL1	P53847	RPN7	YPR108W	1290 nt		5.86	□□□□□ -1.47
DSL1	P53847	ERC1	YHR032W	1746 nt		5.85	□□□□□ -1.47
DSL1	P53847	PPR1	YLR014C	2715 nt		5.85	□□□□□ -1.47
DSL1	P53847	CTS2	YDR371W	1536 nt		5.85	□□□□□ -1.47
DSL1	P53847	VTC2	YFL004W	2487 nt		5.85	□□□□□ -1.47
DSL1	P53847	WHI2	YOR043W	1461 nt		5.85	□□□□□ -1.47
DSL1	P53847	HST3	YOR025W	1344 nt		5.85	□□□□□ -1.47
DSL1	P53847	YDR401W	YDR401W	564 nt		5.85	□□□□□ -1.47
DSL1	P53847	TOM20	YGR082W	552 nt		5.85	□□□□□ -1.47
DSL1	P53847	RRS1	YOR294W	612 nt		5.85	□□□□□ -1.47
DSL1	P53847	PYC1	YGL062W	3537 nt		5.85	□□□□□ -1.47
DSL1	P53847	KKQ8	YKL168C	2175 nt		5.84	□□□□□ -1.47
DSL1	P53847	OPT1	YJL212C	2400 nt		5.84	□□□□□ -1.47
DSL1	P53847	SUP2	tY(GUA)D	75 nt		5.84	□□□□□ -1.47
DSL1	P53847	SUP11	tY(GUA)F1	75 nt		5.84	□□□□□ -1.47
DSL1	P53847	SUP6	tY(GUA)F2	75 nt		5.84	□□□□□ -1.47
DSL1	P53847	SUP7	tY(GUA)J1	75 nt		5.84	□□□□□ -1.47
DSL1	P53847	SUP4	tY(GUA)J2	75 nt		5.84	□□□□□ -1.47
DSL1	P53847	SUP5	tY(GUA)M1	75 nt		5.84	□□□□□ -1.47
DSL1	P53847	SUP8	tY(GUA)M2	75 nt		5.84	□□□□□ -1.47
DSL1	P53847	SUP3	tY(GUA)O	75 nt		5.84	□□□□□ -1.47
DSL1	P53847	YKL153W	YKL153W	510 nt		5.84	□□□□□ -1.47
DSL1	P53847	PUS4	YNL292W	1212 nt		5.84	□□□□□ -1.47
DSL1	P53847	PWP1	YLR196W	1731 nt		5.84	□□□□□ -1.47
DSL1	P53847	TRP1	YDR007W	675 nt		5.83	□□□□□ -1.48
DSL1	P53847	GLC8	YMR311C	690 nt		5.83	□□□□□ -1.48
DSL1	P53847	YNR040W	YNR040W	771 nt		5.83	□□□□□ -1.48
DSL1	P53847	COS10	YNR075W	1125 nt		5.83	□□□□□ -1.48
DSL1	P53847	YBR027C	YBR027C	333 nt		5.83	□□□□□ -1.48
DSL1	P53847	HST2	YPL015C	1074 nt		5.83	□□□□□ -1.48
DSL1	P53847	NTH2	YBR001C	2343 nt		5.83	□□□□□ -1.48
DSL1	P53847	NSI1	YDR026C	1713 nt		5.82	□□□□□ -1.48
DSL1	P53847	NHA1	YLR138W	2958 nt		5.82	□□□□□ -1.48
DSL1	P53847	TFC6	YDR362C	2019 nt		5.82	□□□□□ -1.48
DSL1	P53847	RRN3	YKL125W	1884 nt		5.82	□□□□□ -1.48
DSL1	P53847	VNX1	YNL321W	2727 nt		5.82	□□□□□ -1.48
DSL1	P53847	NCS6	YGL211W	1080 nt		5.82	□□□□□ -1.48
DSL1	P53847	ECM14	YHR132C	1293 nt		5.82	□□□□□ -1.48
DSL1	P53847	CTR2	YHR175W	570 nt		5.82	□□□□□ -1.48
DSL1	P53847	YIR020W-A	YIR020W-A	243 nt		5.82	□□□□□ -1.48
DSL1	P53847	TSA1	YML028W	591 nt		5.82	□□□□□ -1.48
DSL1	P53847	PFA3	YNL326C	1011 nt		5.82	□□□□□ -1.48
DSL1	P53847	ILV6	YCL009C	930 nt		5.82	□□□□□ -1.48
DSL1	P53847	UBX2	YML013W	1755 nt		5.82	□□□□□ -1.48
DSL1	P53847	ENP1	YBR247C	1452 nt		5.82	□□□□□ -1.48
DSL1	P53847	PIF1	YML061C	2580 nt		5.81	□□□□□ -1.48
DSL1	P53847	GAT1	YFL021W	1533 nt		5.81	□□□□□ -1.48
DSL1	P53847	FRS2	YFL022C	1512 nt		5.81	□□□□□ -1.48
DSL1	P53847	NGL2	YMR285C	1548 nt		5.81	□□□□□ -1.48
DSL1	P53847	DEF1	YKL054C	2217 nt		5.81	□□□□□ -1.48
DSL1	P53847	YIL029W-A	YIL029W-A	372 nt		5.81	□□□□□ -1.48
DSL1	P53847	LDS1	YAL018C	978 nt		5.81	□□□□□ -1.48
DSL1	P53847	YHM2	YMR241W	945 nt		5.81	□□□□□ -1.48
DSL1	P53847	RRT2	YBR246W	1164 nt		5.81	□□□□□ -1.48
DSL1	P53847	SGF29	YCL010C	780 nt		5.81	□□□□□ -1.48
DSL1	P53847	ISN1	YOR155C	1353 nt		5.8	□□□□□ -1.48
DSL1	P53847	MNN2	YBR015C	1794 nt		5.8	□□□□□ -1.48
DSL1	P53847	SDH4	YDR178W	546 nt		5.8	□□□□□ -1.48
DSL1	P53847	RPN11	YFR004W	921 nt		5.8	□□□□□ -1.48
DSL1	P53847	MID1	YNL291C	1647 nt		5.8	□□□□□ -1.48
DSL1	P53847	YMR027W	YMR027W	1413 nt		5.8	□□□□□ -1.48
DSL1	P53847	ATG23	YLR431C	1362 nt		5.8	□□□□□ -1.48
DSL1	P53847	ERG1	YGR175C	1491 nt		5.79	□□□□□ -1.48
DSL1	P53847	MET7	YOR241W	1647 nt		5.79	□□□□□ -1.48
DSL1	P53847	IMG1	YCR046C	510 nt		5.79	□□□□□ -1.48
DSL1	P53847	BUD32	YGR262C	786 nt		5.79	□□□□□ -1.48
DSL1	P53847	REV7	YIL139C	738 nt		5.79	□□□□□ -1.48
DSL1	P53847	TAE1	YBR261C	699 nt		5.79	□□□□□ -1.48
DSL1	P53847	CYK3	YDL117W	2658 nt		5.79	□□□□□ -1.48
DSL1	P53847	ATE1	YGL017W	1512 nt		5.79	□□□□□ -1.48
DSL1	P53847	CRF1	YDR223W	1404 nt		5.78	□□□□□ -1.48
DSL1	P53847	MRPS16	YPL013C	366 nt		5.78	□□□□□ -1.48
DSL1	P53847	ERI1	YPL096C-A	207 nt		5.78	□□□□□ -1.48
DSL1	P53847	HXT5	YHR096C	1779 nt		5.78	□□□□□ -1.48
DSL1	P53847	TUL1	YKL034W	2277 nt		5.77	□□□□□ -1.49
DSL1	P53847	DBF4	YDR052C	2115 nt		5.77	□□□□□ -1.49
DSL1	P53847	MCX1	YBR227C	1563 nt		5.77	□□□□□ -1.49
DSL1	P53847	YEL068C	YEL068C	333 nt		5.77	□□□□□ -1.49
DSL1	P53847	tR(ACG)D	tR(ACG)D	73 nt		5.77	□□□□□ -1.49
DSL1	P53847	tR(ACG)E	tR(ACG)E	73 nt		5.77	□□□□□ -1.49
DSL1	P53847	tR(ACG)K	tR(ACG)K	73 nt		5.77	□□□□□ -1.49
DSL1	P53847	tR(ACG)L	tR(ACG)L	73 nt		5.77	□□□□□ -1.49
DSL1	P53847	tR(ACG)O	tR(ACG)O	73 nt		5.77	□□□□□ -1.49
DSL1	P53847	SCS7	YMR272C	1155 nt		5.77	□□□□□ -1.49
DSL1	P53847	CAM1	YPL048W	1248 nt		5.77	□□□□□ -1.49
DSL1	P53847	YNL095C	YNL095C	1929 nt		5.77	□□□□□ -1.49
DSL1	P53847	DFG5	YMR238W	1377 nt		5.77	□□□□□ -1.49
DSL1	P53847	RAD3	YER171W	2337 nt		5.76	□□□□□ -1.49
DSL1	P53847	RVB2	YPL235W	1416 nt		5.76	□□□□□ -1.49
DSL1	P53847	VCX1	YDL128W	1236 nt		5.76	□□□□□ -1.49
DSL1	P53847	CUP2	YGL166W	678 nt		5.76	□□□□□ -1.49
DSL1	P53847	MED6	YHR058C	888 nt		5.76	□□□□□ -1.49
DSL1	P53847	YJU3	YKL094W	942 nt		5.76	□□□□□ -1.49

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