Protein–RNA interactions for Protein: P53611

RABGGTB, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTBP53611 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RABGGTBP53611 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RABGGTBP53611 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RABGGTBP53611 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RABGGTBP53611 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RABGGTBP53611 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RABGGTBP53611 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RABGGTBP53611 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RABGGTBP53611 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RABGGTBP53611 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RABGGTBP53611 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RABGGTBP53611 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RABGGTBP53611 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RABGGTBP53611 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RABGGTBP53611 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RABGGTBP53611 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RABGGTBP53611 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RABGGTBP53611 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RABGGTBP53611 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RABGGTBP53611 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RABGGTBP53611 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RABGGTBP53611 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RABGGTBP53611 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RABGGTBP53611 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RABGGTBP53611 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RABGGTBP53611 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RABGGTBP53611 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RABGGTBP53611 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RABGGTBP53611 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RABGGTBP53611 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RABGGTBP53611 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RABGGTBP53611 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RABGGTBP53611 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RABGGTBP53611 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RABGGTBP53611 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RABGGTBP53611 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RABGGTBP53611 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RABGGTBP53611 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RABGGTBP53611 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RABGGTBP53611 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RABGGTBP53611 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RABGGTBP53611 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RABGGTBP53611 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RABGGTBP53611 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RABGGTBP53611 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RABGGTBP53611 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RABGGTBP53611 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RABGGTBP53611 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RABGGTBP53611 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RABGGTBP53611 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RABGGTBP53611 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RABGGTBP53611 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RABGGTBP53611 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RABGGTBP53611 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RABGGTBP53611 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RABGGTBP53611 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RABGGTBP53611 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RABGGTBP53611 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RABGGTBP53611 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RABGGTBP53611 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RABGGTBP53611 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RABGGTBP53611 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RABGGTBP53611 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RABGGTBP53611 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RABGGTBP53611 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RABGGTBP53611 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RABGGTBP53611 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RABGGTBP53611 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RABGGTBP53611 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RABGGTBP53611 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RABGGTBP53611 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RABGGTBP53611 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RABGGTBP53611 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RABGGTBP53611 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RABGGTBP53611 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RABGGTBP53611 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RABGGTBP53611 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RABGGTBP53611 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RABGGTBP53611 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RABGGTBP53611 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RABGGTBP53611 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RABGGTBP53611 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RABGGTBP53611 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RABGGTBP53611 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RABGGTBP53611 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RABGGTBP53611 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RABGGTBP53611 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RABGGTBP53611 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RABGGTBP53611 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RABGGTBP53611 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RABGGTBP53611 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RABGGTBP53611 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RABGGTBP53611 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RABGGTBP53611 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RABGGTBP53611 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RABGGTBP53611 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RABGGTBP53611 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RABGGTBP53611 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RABGGTBP53611 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RABGGTBP53611 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
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