Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
NKX2-5P52952 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NKX2-5P52952 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NKX2-5P52952 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NKX2-5P52952 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NKX2-5P52952 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NKX2-5P52952 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NKX2-5P52952 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NKX2-5P52952 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NKX2-5P52952 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NKX2-5P52952 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NKX2-5P52952 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NKX2-5P52952 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NKX2-5P52952 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NKX2-5P52952 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NKX2-5P52952 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NKX2-5P52952 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NKX2-5P52952 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NKX2-5P52952 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NKX2-5P52952 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NKX2-5P52952 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NKX2-5P52952 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NKX2-5P52952 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NKX2-5P52952 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NKX2-5P52952 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NKX2-5P52952 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKX2-5P52952 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKX2-5P52952 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKX2-5P52952 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKX2-5P52952 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKX2-5P52952 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKX2-5P52952 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKX2-5P52952 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKX2-5P52952 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKX2-5P52952 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKX2-5P52952 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKX2-5P52952 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKX2-5P52952 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKX2-5P52952 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKX2-5P52952 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NKX2-5P52952 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NKX2-5P52952 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NKX2-5P52952 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NKX2-5P52952 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NKX2-5P52952 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NKX2-5P52952 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NKX2-5P52952 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NKX2-5P52952 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NKX2-5P52952 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NKX2-5P52952 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NKX2-5P52952 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NKX2-5P52952 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NKX2-5P52952 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKX2-5P52952 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKX2-5P52952 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKX2-5P52952 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKX2-5P52952 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKX2-5P52952 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKX2-5P52952 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKX2-5P52952 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKX2-5P52952 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKX2-5P52952 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKX2-5P52952 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKX2-5P52952 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKX2-5P52952 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKX2-5P52952 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKX2-5P52952 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKX2-5P52952 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKX2-5P52952 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKX2-5P52952 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKX2-5P52952 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKX2-5P52952 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKX2-5P52952 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKX2-5P52952 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKX2-5P52952 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKX2-5P52952 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKX2-5P52952 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKX2-5P52952 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKX2-5P52952 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKX2-5P52952 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKX2-5P52952 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKX2-5P52952 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NKX2-5P52952 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NKX2-5P52952 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NKX2-5P52952 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NKX2-5P52952 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NKX2-5P52952 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NKX2-5P52952 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NKX2-5P52952 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms