Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NDST1P52848 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NDST1P52848 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NDST1P52848 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NDST1P52848 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NDST1P52848 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NDST1P52848 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NDST1P52848 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NDST1P52848 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NDST1P52848 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NDST1P52848 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NDST1P52848 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NDST1P52848 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NDST1P52848 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NDST1P52848 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NDST1P52848 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NDST1P52848 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NDST1P52848 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NDST1P52848 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NDST1P52848 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NDST1P52848 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NDST1P52848 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NDST1P52848 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NDST1P52848 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NDST1P52848 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NDST1P52848 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NDST1P52848 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NDST1P52848 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NDST1P52848 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NDST1P52848 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NDST1P52848 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NDST1P52848 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NDST1P52848 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NDST1P52848 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NDST1P52848 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NDST1P52848 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NDST1P52848 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NDST1P52848 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NDST1P52848 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NDST1P52848 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NDST1P52848 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NDST1P52848 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NDST1P52848 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NDST1P52848 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NDST1P52848 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NDST1P52848 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NDST1P52848 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NDST1P52848 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NDST1P52848 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NDST1P52848 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NDST1P52848 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NDST1P52848 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NDST1P52848 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NDST1P52848 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NDST1P52848 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NDST1P52848 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NDST1P52848 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NDST1P52848 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NDST1P52848 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NDST1P52848 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NDST1P52848 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NDST1P52848 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NDST1P52848 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NDST1P52848 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NDST1P52848 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NDST1P52848 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NDST1P52848 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NDST1P52848 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NDST1P52848 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NDST1P52848 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NDST1P52848 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NDST1P52848 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NDST1P52848 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NDST1P52848 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NDST1P52848 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NDST1P52848 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NDST1P52848 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NDST1P52848 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NDST1P52848 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NDST1P52848 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NDST1P52848 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NDST1P52848 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NDST1P52848 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NDST1P52848 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NDST1P52848 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NDST1P52848 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NDST1P52848 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NDST1P52848 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NDST1P52848 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NDST1P52848 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NDST1P52848 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NDST1P52848 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NDST1P52848 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NDST1P52848 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NDST1P52848 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NDST1P52848 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NDST1P52848 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NDST1P52848 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NDST1P52848 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NDST1P52848 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms