Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2A1P52655 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2A1P52655 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2A1P52655 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2A1P52655 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2A1P52655 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2A1P52655 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2A1P52655 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2A1P52655 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2A1P52655 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2A1P52655 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2A1P52655 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2A1P52655 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2A1P52655 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2A1P52655 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2A1P52655 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2A1P52655 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2A1P52655 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2A1P52655 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2A1P52655 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2A1P52655 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2A1P52655 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2A1P52655 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2A1P52655 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2A1P52655 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GTF2A1P52655 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GTF2A1P52655 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GTF2A1P52655 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2A1P52655 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2A1P52655 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2A1P52655 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2A1P52655 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2A1P52655 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2A1P52655 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2A1P52655 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2A1P52655 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2A1P52655 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2A1P52655 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2A1P52655 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2A1P52655 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2A1P52655 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2A1P52655 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2A1P52655 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2A1P52655 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2A1P52655 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2A1P52655 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2A1P52655 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2A1P52655 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2A1P52655 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2A1P52655 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2A1P52655 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2A1P52655 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2A1P52655 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2A1P52655 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2A1P52655 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2A1P52655 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2A1P52655 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2A1P52655 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2A1P52655 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2A1P52655 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2A1P52655 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2A1P52655 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2A1P52655 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2A1P52655 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2A1P52655 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2A1P52655 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2A1P52655 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2A1P52655 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2A1P52655 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2A1P52655 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2A1P52655 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2A1P52655 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2A1P52655 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2A1P52655 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2A1P52655 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2A1P52655 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2A1P52655 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2A1P52655 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2A1P52655 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2A1P52655 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GTF2A1P52655 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GTF2A1P52655 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GTF2A1P52655 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2A1P52655 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2A1P52655 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2A1P52655 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2A1P52655 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2A1P52655 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2A1P52655 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2A1P52655 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2A1P52655 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2A1P52655 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2A1P52655 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2A1P52655 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2A1P52655 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2A1P52655 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2A1P52655 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2A1P52655 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2A1P52655 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2A1P52655 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms