Protein–RNA interactions for Protein: P51668

UBE2D1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D1P51668 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2D1P51668 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
UBE2D1P51668 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms