Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DAP3P51398 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DAP3P51398 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DAP3P51398 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DAP3P51398 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DAP3P51398 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DAP3P51398 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DAP3P51398 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DAP3P51398 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
DAP3P51398 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
DAP3P51398 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DAP3P51398 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DAP3P51398 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DAP3P51398 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DAP3P51398 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DAP3P51398 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DAP3P51398 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DAP3P51398 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DAP3P51398 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DAP3P51398 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
DAP3P51398 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DAP3P51398 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DAP3P51398 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DAP3P51398 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DAP3P51398 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DAP3P51398 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DAP3P51398 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DAP3P51398 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DAP3P51398 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DAP3P51398 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DAP3P51398 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DAP3P51398 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DAP3P51398 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DAP3P51398 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
DAP3P51398 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DAP3P51398 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DAP3P51398 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DAP3P51398 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DAP3P51398 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DAP3P51398 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DAP3P51398 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DAP3P51398 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DAP3P51398 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DAP3P51398 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DAP3P51398 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DAP3P51398 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DAP3P51398 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DAP3P51398 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DAP3P51398 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DAP3P51398 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DAP3P51398 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DAP3P51398 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
DAP3P51398 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DAP3P51398 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DAP3P51398 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DAP3P51398 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DAP3P51398 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DAP3P51398 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
DAP3P51398 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DAP3P51398 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DAP3P51398 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DAP3P51398 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DAP3P51398 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DAP3P51398 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DAP3P51398 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DAP3P51398 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DAP3P51398 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DAP3P51398 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DAP3P51398 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DAP3P51398 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
DAP3P51398 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
DAP3P51398 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DAP3P51398 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DAP3P51398 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DAP3P51398 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DAP3P51398 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DAP3P51398 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DAP3P51398 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DAP3P51398 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DAP3P51398 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DAP3P51398 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DAP3P51398 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DAP3P51398 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DAP3P51398 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DAP3P51398 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DAP3P51398 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DAP3P51398 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DAP3P51398 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DAP3P51398 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DAP3P51398 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DAP3P51398 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DAP3P51398 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DAP3P51398 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DAP3P51398 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DAP3P51398 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DAP3P51398 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DAP3P51398 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DAP3P51398 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DAP3P51398 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DAP3P51398 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms