Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ETV1P50549 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ETV1P50549 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ETV1P50549 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ETV1P50549 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ETV1P50549 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ETV1P50549 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ETV1P50549 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ETV1P50549 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ETV1P50549 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ETV1P50549 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ETV1P50549 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ETV1P50549 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ETV1P50549 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ETV1P50549 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ETV1P50549 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ETV1P50549 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ETV1P50549 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ETV1P50549 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ETV1P50549 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ETV1P50549 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ETV1P50549 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ETV1P50549 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ETV1P50549 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ETV1P50549 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ETV1P50549 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ETV1P50549 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ETV1P50549 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ETV1P50549 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ETV1P50549 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ETV1P50549 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ETV1P50549 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ETV1P50549 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ETV1P50549 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ETV1P50549 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ETV1P50549 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ETV1P50549 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ETV1P50549 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ETV1P50549 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ETV1P50549 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ETV1P50549 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ETV1P50549 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ETV1P50549 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ETV1P50549 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ETV1P50549 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ETV1P50549 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ETV1P50549 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ETV1P50549 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ETV1P50549 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ETV1P50549 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ETV1P50549 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ETV1P50549 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ETV1P50549 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ETV1P50549 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ETV1P50549 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ETV1P50549 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ETV1P50549 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ETV1P50549 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ETV1P50549 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ETV1P50549 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ETV1P50549 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ETV1P50549 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ETV1P50549 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ETV1P50549 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ETV1P50549 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ETV1P50549 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ETV1P50549 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ETV1P50549 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ETV1P50549 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ETV1P50549 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ETV1P50549 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ETV1P50549 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ETV1P50549 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ETV1P50549 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ETV1P50549 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ETV1P50549 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ETV1P50549 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ETV1P50549 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ETV1P50549 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ETV1P50549 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ETV1P50549 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ETV1P50549 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ETV1P50549 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ETV1P50549 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ETV1P50549 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ETV1P50549 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ETV1P50549 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ETV1P50549 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ETV1P50549 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ETV1P50549 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ETV1P50549 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ETV1P50549 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ETV1P50549 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ETV1P50549 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ETV1P50549 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ETV1P50549 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ETV1P50549 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ETV1P50549 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ETV1P50549 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ETV1P50549 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.8 ms