Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSK3BP49841 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSK3BP49841 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSK3BP49841 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSK3BP49841 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSK3BP49841 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSK3BP49841 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSK3BP49841 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSK3BP49841 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSK3BP49841 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSK3BP49841 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSK3BP49841 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSK3BP49841 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSK3BP49841 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSK3BP49841 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSK3BP49841 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSK3BP49841 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSK3BP49841 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSK3BP49841 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSK3BP49841 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSK3BP49841 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSK3BP49841 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSK3BP49841 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSK3BP49841 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSK3BP49841 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GSK3BP49841 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSK3BP49841 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSK3BP49841 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSK3BP49841 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSK3BP49841 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSK3BP49841 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSK3BP49841 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSK3BP49841 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSK3BP49841 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSK3BP49841 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSK3BP49841 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSK3BP49841 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSK3BP49841 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSK3BP49841 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSK3BP49841 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSK3BP49841 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSK3BP49841 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSK3BP49841 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSK3BP49841 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSK3BP49841 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSK3BP49841 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSK3BP49841 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSK3BP49841 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSK3BP49841 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSK3BP49841 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSK3BP49841 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSK3BP49841 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSK3BP49841 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSK3BP49841 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSK3BP49841 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSK3BP49841 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSK3BP49841 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSK3BP49841 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSK3BP49841 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSK3BP49841 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSK3BP49841 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSK3BP49841 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSK3BP49841 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSK3BP49841 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSK3BP49841 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSK3BP49841 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GSK3BP49841 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GSK3BP49841 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GSK3BP49841 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSK3BP49841 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSK3BP49841 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSK3BP49841 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSK3BP49841 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSK3BP49841 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSK3BP49841 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSK3BP49841 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSK3BP49841 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSK3BP49841 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSK3BP49841 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSK3BP49841 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSK3BP49841 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSK3BP49841 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSK3BP49841 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSK3BP49841 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GSK3BP49841 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GSK3BP49841 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSK3BP49841 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSK3BP49841 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GSK3BP49841 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSK3BP49841 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSK3BP49841 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSK3BP49841 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSK3BP49841 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSK3BP49841 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSK3BP49841 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSK3BP49841 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSK3BP49841 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSK3BP49841 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSK3BP49841 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSK3BP49841 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms