Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMAN1P49257 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMAN1P49257 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMAN1P49257 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMAN1P49257 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMAN1P49257 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMAN1P49257 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LMAN1P49257 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMAN1P49257 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LMAN1P49257 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMAN1P49257 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMAN1P49257 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMAN1P49257 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMAN1P49257 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMAN1P49257 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMAN1P49257 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMAN1P49257 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMAN1P49257 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMAN1P49257 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMAN1P49257 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMAN1P49257 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMAN1P49257 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMAN1P49257 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LMAN1P49257 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LMAN1P49257 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMAN1P49257 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMAN1P49257 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMAN1P49257 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMAN1P49257 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMAN1P49257 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMAN1P49257 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMAN1P49257 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMAN1P49257 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMAN1P49257 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMAN1P49257 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMAN1P49257 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMAN1P49257 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMAN1P49257 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMAN1P49257 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMAN1P49257 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMAN1P49257 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMAN1P49257 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMAN1P49257 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMAN1P49257 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMAN1P49257 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMAN1P49257 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMAN1P49257 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMAN1P49257 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMAN1P49257 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMAN1P49257 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMAN1P49257 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMAN1P49257 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMAN1P49257 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMAN1P49257 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMAN1P49257 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMAN1P49257 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMAN1P49257 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMAN1P49257 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMAN1P49257 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMAN1P49257 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMAN1P49257 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LMAN1P49257 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMAN1P49257 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMAN1P49257 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMAN1P49257 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMAN1P49257 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMAN1P49257 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMAN1P49257 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMAN1P49257 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMAN1P49257 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMAN1P49257 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LMAN1P49257 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMAN1P49257 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMAN1P49257 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMAN1P49257 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMAN1P49257 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMAN1P49257 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMAN1P49257 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMAN1P49257 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMAN1P49257 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMAN1P49257 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMAN1P49257 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMAN1P49257 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMAN1P49257 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMAN1P49257 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMAN1P49257 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMAN1P49257 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMAN1P49257 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMAN1P49257 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMAN1P49257 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMAN1P49257 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMAN1P49257 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMAN1P49257 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMAN1P49257 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMAN1P49257 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMAN1P49257 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMAN1P49257 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMAN1P49257 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMAN1P49257 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMAN1P49257 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms