Protein–RNA interactions for Protein: P43657

LPAR6, Lysophosphatidic acid receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPAR6P43657 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LPAR6P43657 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LPAR6P43657 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LPAR6P43657 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LPAR6P43657 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LPAR6P43657 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LPAR6P43657 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LPAR6P43657 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LPAR6P43657 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LPAR6P43657 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LPAR6P43657 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LPAR6P43657 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LPAR6P43657 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LPAR6P43657 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LPAR6P43657 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LPAR6P43657 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LPAR6P43657 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LPAR6P43657 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LPAR6P43657 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LPAR6P43657 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LPAR6P43657 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LPAR6P43657 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LPAR6P43657 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LPAR6P43657 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LPAR6P43657 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LPAR6P43657 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LPAR6P43657 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LPAR6P43657 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LPAR6P43657 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LPAR6P43657 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LPAR6P43657 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LPAR6P43657 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LPAR6P43657 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LPAR6P43657 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LPAR6P43657 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LPAR6P43657 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LPAR6P43657 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LPAR6P43657 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LPAR6P43657 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LPAR6P43657 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LPAR6P43657 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LPAR6P43657 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LPAR6P43657 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LPAR6P43657 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LPAR6P43657 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LPAR6P43657 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LPAR6P43657 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
LPAR6P43657 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LPAR6P43657 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LPAR6P43657 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LPAR6P43657 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LPAR6P43657 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LPAR6P43657 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LPAR6P43657 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
LPAR6P43657 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
LPAR6P43657 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LPAR6P43657 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LPAR6P43657 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LPAR6P43657 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LPAR6P43657 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LPAR6P43657 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LPAR6P43657 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LPAR6P43657 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LPAR6P43657 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LPAR6P43657 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LPAR6P43657 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LPAR6P43657 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LPAR6P43657 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LPAR6P43657 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LPAR6P43657 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LPAR6P43657 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LPAR6P43657 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LPAR6P43657 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LPAR6P43657 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LPAR6P43657 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LPAR6P43657 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LPAR6P43657 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LPAR6P43657 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LPAR6P43657 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LPAR6P43657 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LPAR6P43657 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LPAR6P43657 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LPAR6P43657 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LPAR6P43657 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LPAR6P43657 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LPAR6P43657 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LPAR6P43657 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LPAR6P43657 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LPAR6P43657 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LPAR6P43657 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LPAR6P43657 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LPAR6P43657 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LPAR6P43657 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LPAR6P43657 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LPAR6P43657 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LPAR6P43657 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LPAR6P43657 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LPAR6P43657 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LPAR6P43657 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LPAR6P43657 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms