Protein–RNA interactions for Protein: P43378

PTPN9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN9P43378 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN9P43378 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN9P43378 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN9P43378 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN9P43378 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN9P43378 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN9P43378 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN9P43378 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN9P43378 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN9P43378 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN9P43378 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN9P43378 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN9P43378 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN9P43378 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN9P43378 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN9P43378 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN9P43378 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN9P43378 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN9P43378 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN9P43378 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN9P43378 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN9P43378 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN9P43378 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN9P43378 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN9P43378 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN9P43378 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN9P43378 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN9P43378 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN9P43378 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN9P43378 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN9P43378 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN9P43378 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN9P43378 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN9P43378 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN9P43378 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN9P43378 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN9P43378 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN9P43378 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN9P43378 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN9P43378 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN9P43378 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN9P43378 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN9P43378 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN9P43378 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN9P43378 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN9P43378 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN9P43378 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN9P43378 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN9P43378 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN9P43378 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN9P43378 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN9P43378 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN9P43378 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN9P43378 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPN9P43378 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPN9P43378 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPN9P43378 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPN9P43378 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPN9P43378 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPN9P43378 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPN9P43378 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPN9P43378 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPN9P43378 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN9P43378 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN9P43378 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN9P43378 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN9P43378 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN9P43378 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN9P43378 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN9P43378 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN9P43378 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN9P43378 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN9P43378 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN9P43378 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN9P43378 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN9P43378 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN9P43378 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN9P43378 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN9P43378 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN9P43378 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN9P43378 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN9P43378 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN9P43378 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN9P43378 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN9P43378 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN9P43378 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN9P43378 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN9P43378 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN9P43378 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN9P43378 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN9P43378 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN9P43378 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN9P43378 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN9P43378 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN9P43378 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN9P43378 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN9P43378 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN9P43378 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN9P43378 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN9P43378 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms