Protein–RNA interactions for Protein: P42858

HTT, Huntingtin, humanhuman

Predictions only

Length 3,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTTP42858 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HTTP42858 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HTTP42858 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HTTP42858 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HTTP42858 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HTTP42858 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HTTP42858 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HTTP42858 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HTTP42858 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HTTP42858 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
HTTP42858 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HTTP42858 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HTTP42858 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HTTP42858 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HTTP42858 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HTTP42858 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
HTTP42858 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HTTP42858 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HTTP42858 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
HTTP42858 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HTTP42858 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
HTTP42858 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HTTP42858 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HTTP42858 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HTTP42858 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HTTP42858 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HTTP42858 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HTTP42858 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
HTTP42858 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HTTP42858 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HTTP42858 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HTTP42858 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HTTP42858 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HTTP42858 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HTTP42858 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HTTP42858 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HTTP42858 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HTTP42858 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HTTP42858 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HTTP42858 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HTTP42858 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HTTP42858 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HTTP42858 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
HTTP42858 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HTTP42858 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HTTP42858 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HTTP42858 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
HTTP42858 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
HTTP42858 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HTTP42858 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HTTP42858 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
HTTP42858 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HTTP42858 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HTTP42858 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HTTP42858 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HTTP42858 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HTTP42858 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
HTTP42858 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
HTTP42858 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HTTP42858 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HTTP42858 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HTTP42858 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
HTTP42858 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HTTP42858 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
HTTP42858 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
HTTP42858 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HTTP42858 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HTTP42858 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HTTP42858 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HTTP42858 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HTTP42858 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HTTP42858 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HTTP42858 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HTTP42858 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HTTP42858 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HTTP42858 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HTTP42858 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HTTP42858 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HTTP42858 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HTTP42858 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HTTP42858 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HTTP42858 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HTTP42858 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HTTP42858 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HTTP42858 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HTTP42858 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HTTP42858 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HTTP42858 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HTTP42858 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
HTTP42858 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HTTP42858 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HTTP42858 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HTTP42858 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HTTP42858 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HTTP42858 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HTTP42858 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HTTP42858 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HTTP42858 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HTTP42858 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HTTP42858 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms