Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC1P41238 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC1P41238 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC1P41238 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC1P41238 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC1P41238 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC1P41238 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC1P41238 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC1P41238 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC1P41238 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC1P41238 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC1P41238 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC1P41238 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC1P41238 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC1P41238 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC1P41238 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC1P41238 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC1P41238 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC1P41238 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC1P41238 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC1P41238 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC1P41238 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC1P41238 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC1P41238 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC1P41238 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC1P41238 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC1P41238 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC1P41238 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC1P41238 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC1P41238 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC1P41238 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC1P41238 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC1P41238 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC1P41238 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC1P41238 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC1P41238 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC1P41238 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC1P41238 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC1P41238 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC1P41238 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC1P41238 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC1P41238 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC1P41238 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC1P41238 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC1P41238 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC1P41238 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC1P41238 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC1P41238 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC1P41238 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC1P41238 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC1P41238 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC1P41238 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC1P41238 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC1P41238 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC1P41238 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC1P41238 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC1P41238 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC1P41238 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC1P41238 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC1P41238 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC1P41238 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC1P41238 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC1P41238 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC1P41238 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC1P41238 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC1P41238 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC1P41238 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC1P41238 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC1P41238 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC1P41238 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC1P41238 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC1P41238 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC1P41238 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC1P41238 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC1P41238 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC1P41238 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOBEC1P41238 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOBEC1P41238 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOBEC1P41238 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOBEC1P41238 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
APOBEC1P41238 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOBEC1P41238 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOBEC1P41238 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC1P41238 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC1P41238 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC1P41238 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC1P41238 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC1P41238 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC1P41238 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC1P41238 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC1P41238 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC1P41238 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC1P41238 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC1P41238 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC1P41238 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC1P41238 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC1P41238 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC1P41238 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC1P41238 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC1P41238 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms