Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRPHP41219 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PRPHP41219 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRPHP41219 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PRPHP41219 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRPHP41219 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PRPHP41219 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRPHP41219 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRPHP41219 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PRPHP41219 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRPHP41219 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRPHP41219 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRPHP41219 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRPHP41219 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRPHP41219 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRPHP41219 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRPHP41219 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRPHP41219 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRPHP41219 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRPHP41219 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRPHP41219 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRPHP41219 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRPHP41219 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRPHP41219 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRPHP41219 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PRPHP41219 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PRPHP41219 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRPHP41219 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRPHP41219 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRPHP41219 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRPHP41219 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRPHP41219 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRPHP41219 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRPHP41219 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRPHP41219 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRPHP41219 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRPHP41219 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PRPHP41219 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRPHP41219 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPHP41219 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPHP41219 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPHP41219 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPHP41219 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPHP41219 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPHP41219 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPHP41219 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPHP41219 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPHP41219 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRPHP41219 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRPHP41219 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRPHP41219 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRPHP41219 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRPHP41219 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRPHP41219 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRPHP41219 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRPHP41219 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRPHP41219 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRPHP41219 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRPHP41219 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRPHP41219 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRPHP41219 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRPHP41219 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRPHP41219 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRPHP41219 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRPHP41219 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRPHP41219 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRPHP41219 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRPHP41219 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRPHP41219 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRPHP41219 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRPHP41219 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PRPHP41219 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRPHP41219 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRPHP41219 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRPHP41219 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRPHP41219 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRPHP41219 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPHP41219 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPHP41219 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPHP41219 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPHP41219 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPHP41219 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPHP41219 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPHP41219 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPHP41219 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPHP41219 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPHP41219 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPHP41219 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPHP41219 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPHP41219 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRPHP41219 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRPHP41219 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRPHP41219 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRPHP41219 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRPHP41219 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRPHP41219 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRPHP41219 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRPHP41219 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRPHP41219 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRPHP41219 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms