Protein–RNA interactions for Protein: P40617

ARL4A, ADP-ribosylation factor-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4AP40617 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARL4AP40617 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ARL4AP40617 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARL4AP40617 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARL4AP40617 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARL4AP40617 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARL4AP40617 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARL4AP40617 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARL4AP40617 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARL4AP40617 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ARL4AP40617 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARL4AP40617 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARL4AP40617 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARL4AP40617 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ARL4AP40617 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARL4AP40617 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARL4AP40617 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARL4AP40617 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARL4AP40617 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARL4AP40617 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARL4AP40617 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARL4AP40617 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARL4AP40617 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ARL4AP40617 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARL4AP40617 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARL4AP40617 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ARL4AP40617 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ARL4AP40617 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARL4AP40617 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARL4AP40617 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ARL4AP40617 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARL4AP40617 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARL4AP40617 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARL4AP40617 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARL4AP40617 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ARL4AP40617 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARL4AP40617 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARL4AP40617 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARL4AP40617 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARL4AP40617 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARL4AP40617 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARL4AP40617 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARL4AP40617 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARL4AP40617 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARL4AP40617 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARL4AP40617 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARL4AP40617 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARL4AP40617 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARL4AP40617 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARL4AP40617 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARL4AP40617 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARL4AP40617 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARL4AP40617 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARL4AP40617 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ARL4AP40617 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARL4AP40617 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARL4AP40617 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARL4AP40617 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARL4AP40617 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARL4AP40617 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARL4AP40617 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARL4AP40617 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARL4AP40617 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARL4AP40617 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARL4AP40617 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARL4AP40617 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ARL4AP40617 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARL4AP40617 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARL4AP40617 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARL4AP40617 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARL4AP40617 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARL4AP40617 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARL4AP40617 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARL4AP40617 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARL4AP40617 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARL4AP40617 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARL4AP40617 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARL4AP40617 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARL4AP40617 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARL4AP40617 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARL4AP40617 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARL4AP40617 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARL4AP40617 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARL4AP40617 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARL4AP40617 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARL4AP40617 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARL4AP40617 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARL4AP40617 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARL4AP40617 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARL4AP40617 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARL4AP40617 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARL4AP40617 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARL4AP40617 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARL4AP40617 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARL4AP40617 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ARL4AP40617 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARL4AP40617 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARL4AP40617 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARL4AP40617 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARL4AP40617 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms