Protein–RNA interactions for Protein: P40501

AVT7, Vacuolar amino acid transporter 7, yeastyeast

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT7P40501 MKK2YPL140C 1521 nt5.18□□□□□ -1.58
AVT7P40501 YPK2YMR104C 2034 nt5.18□□□□□ -1.58
AVT7P40501 GUA1YMR217W 1578 nt5.18□□□□□ -1.58
AVT7P40501 CHO1YER026C 831 nt5.18□□□□□ -1.58
AVT7P40501 YER148W-AYER148W-A 579 nt5.18□□□□□ -1.58
AVT7P40501 FHN1YGR131W 525 nt5.18□□□□□ -1.58
AVT7P40501 ASK1YKL052C 879 nt5.18□□□□□ -1.58
AVT7P40501 JIP4YDR475C 2631 nt5.18□□□□□ -1.58
AVT7P40501 MNS1YJR131W 1650 nt5.18□□□□□ -1.58
AVT7P40501 TFC6YDR362C 2019 nt5.18□□□□□ -1.58
AVT7P40501 ATP1YBL099W 1638 nt5.17□□□□□ -1.58
AVT7P40501 DFM1YDR411C 1026 nt5.17□□□□□ -1.58
AVT7P40501 YER186CYER186C 921 nt5.17□□□□□ -1.58
AVT7P40501 RME1YGR044C 903 nt5.17□□□□□ -1.58
AVT7P40501 LEU5YHR002W 1074 nt5.17□□□□□ -1.58
AVT7P40501 CIN4YMR138W 576 nt5.17□□□□□ -1.58
AVT7P40501 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt5.17□□□□□ -1.58
AVT7P40501 HST2YPL015C 1074 nt5.17□□□□□ -1.58
AVT7P40501 MTF2YDL044C 1323 nt5.17□□□□□ -1.58
AVT7P40501 ERC1YHR032W 1746 nt5.17□□□□□ -1.58
AVT7P40501 HIR1YBL008W 2523 nt5.16□□□□□ -1.58
AVT7P40501 RPS2YGL123W 765 nt5.16□□□□□ -1.58
AVT7P40501 MRPS5YBR251W 924 nt5.16□□□□□ -1.58
AVT7P40501 YEH1YLL012W 1722 nt5.16□□□□□ -1.58
AVT7P40501 OPT1YJL212C 2400 nt5.16□□□□□ -1.58
AVT7P40501 UGX2YDL169C 672 nt5.15□□□□□ -1.59
AVT7P40501 RHO4YKR055W 876 nt5.15□□□□□ -1.59
AVT7P40501 YML012C-AYML012C-A 378 nt5.15□□□□□ -1.59
AVT7P40501 YBL070CYBL070C 321 nt5.15□□□□□ -1.59
AVT7P40501 CSL4YNL232W 879 nt5.15□□□□□ -1.59
AVT7P40501 HSP104YLL026W 2727 nt5.15□□□□□ -1.59
AVT7P40501 DIA3YDL024C 1407 nt5.14□□□□□ -1.59
AVT7P40501 PKC1YBL105C 3456 nt5.14□□□□□ -1.59
AVT7P40501 YDL057WYDL057W 987 nt5.14□□□□□ -1.59
AVT7P40501 RSC30YHR056C 2652 nt5.14□□□□□ -1.59
AVT7P40501 ISN1YOR155C 1353 nt5.14□□□□□ -1.59
AVT7P40501 PYC1YGL062W 3537 nt5.14□□□□□ -1.59
AVT7P40501 RAD24YER173W 1980 nt5.13□□□□□ -1.59
AVT7P40501 IDP1YDL066W 1287 nt5.13□□□□□ -1.59
AVT7P40501 SUP19tS(UGA)E 82 nt5.13□□□□□ -1.59
AVT7P40501 SUP17tS(UGA)I 82 nt5.13□□□□□ -1.59
AVT7P40501 SUP16tS(UGA)P 82 nt5.13□□□□□ -1.59
AVT7P40501 SPO7YAL009W 780 nt5.13□□□□□ -1.59
AVT7P40501 PFA3YNL326C 1011 nt5.13□□□□□ -1.59
AVT7P40501 SCO2YBR024W 906 nt5.13□□□□□ -1.59
AVT7P40501 CPA1YOR303W 1236 nt5.13□□□□□ -1.59
AVT7P40501 GIT1YCR098C 1557 nt5.12□□□□□ -1.59
AVT7P40501 SCT1YBL011W 2280 nt5.12□□□□□ -1.59
AVT7P40501 YRF1-4YLR466W 4149 nt5.12□□□□□ -1.59
AVT7P40501 PAP2YOL115W 1755 nt5.12□□□□□ -1.59
AVT7P40501 PHB1YGR132C 864 nt5.12□□□□□ -1.59
AVT7P40501 CDC11YJR076C 1248 nt5.12□□□□□ -1.59
AVT7P40501 MTC2YKL098W 1074 nt5.12□□□□□ -1.59
AVT7P40501 YBR124WYBR124W 360 nt5.12□□□□□ -1.59
AVT7P40501 TNA1YGR260W 1605 nt5.12□□□□□ -1.59
AVT7P40501 DON1YDR273W 1098 nt5.11□□□□□ -1.59
AVT7P40501 KSS1YGR040W 1107 nt5.11□□□□□ -1.59
AVT7P40501 STM1YLR150W 822 nt5.11□□□□□ -1.59
AVT7P40501 VTH1YIL173W 4650 nt5.11□□□□□ -1.59
AVT7P40501 VTH2YJL222W 4650 nt5.11□□□□□ -1.59
AVT7P40501 COX20YDR231C 618 nt5.1□□□□□ -1.59
AVT7P40501 DJP1YIR004W 1299 nt5.1□□□□□ -1.59
AVT7P40501 YIR007WYIR007W 2295 nt5.1□□□□□ -1.59
AVT7P40501 GUF1YLR289W 1938 nt5.1□□□□□ -1.59
AVT7P40501 YLR296WYLR296W 327 nt5.1□□□□□ -1.59
AVT7P40501 YNL165WYNL165W 1221 nt5.1□□□□□ -1.59
AVT7P40501 MID1YNL291C 1647 nt5.1□□□□□ -1.59
AVT7P40501 IME2YJL106W 1938 nt5.09□□□□□ -1.59
AVT7P40501 HXT17YNR072W 1695 nt5.09□□□□□ -1.59
AVT7P40501 TBF1YPL128C 1689 nt5.09□□□□□ -1.59
AVT7P40501 COR1YBL045C 1374 nt5.09□□□□□ -1.59
AVT7P40501 YDR401WYDR401W 564 nt5.09□□□□□ -1.59
AVT7P40501 AAD15YOL165C 432 nt5.09□□□□□ -1.59
AVT7P40501 ATG12YBR217W 561 nt5.09□□□□□ -1.59
AVT7P40501 RSC2YLR357W 2670 nt5.09□□□□□ -1.6
AVT7P40501 SUB2YDL084W 1341 nt5.08□□□□□ -1.6
AVT7P40501 SIP2YGL208W 1248 nt5.08□□□□□ -1.6
AVT7P40501 LYS12YIL094C 1116 nt5.08□□□□□ -1.6
AVT7P40501 NPA3YJR072C 1158 nt5.08□□□□□ -1.6
AVT7P40501 YLR317WYLR317W 435 nt5.08□□□□□ -1.6
AVT7P40501 OST3YOR085W 1053 nt5.08□□□□□ -1.6
AVT7P40501 MRP51YPL118W 1035 nt5.08□□□□□ -1.6
AVT7P40501 MRK1YDL079C 1506 nt5.07□□□□□ -1.6
AVT7P40501 HSF1YGL073W 2502 nt5.07□□□□□ -1.6
AVT7P40501 PUF3YLL013C 2640 nt5.07□□□□□ -1.6
AVT7P40501 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt5.07□□□□□ -1.6
AVT7P40501 QDR3YBR043C 2070 nt5.07□□□□□ -1.6
AVT7P40501 VPS70YJR126C 2436 nt5.07□□□□□ -1.6
AVT7P40501 SFB3YHR098C 2790 nt5.07□□□□□ -1.6
AVT7P40501 CDC19YAL038W 1503 nt5.07□□□□□ -1.6
AVT7P40501 TRP3YKL211C 1455 nt5.07□□□□□ -1.6
AVT7P40501 MSN2YMR037C 2115 nt5.06□□□□□ -1.6
AVT7P40501 CRZ1YNL027W 2037 nt5.06□□□□□ -1.6
AVT7P40501 ACC1YNR016C 6702 nt5.06□□□□□ -1.6
AVT7P40501 SSK22YCR073C 3996 nt5.06□□□□□ -1.6
AVT7P40501 CBP4YGR174C 513 nt5.06□□□□□ -1.6
AVT7P40501 YKL223WYKL223W 333 nt5.06□□□□□ -1.6
AVT7P40501 GEP5YLR091W 882 nt5.06□□□□□ -1.6
AVT7P40501 SNO4YMR322C 714 nt5.06□□□□□ -1.6
AVT7P40501 HSP33YOR391C 714 nt5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.4 ms