Protein–RNA interactions for Protein: P38798

NMD2, Nonsense-mediated mRNA decay protein 2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,089 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NMD2P38798 UPS3YDR185C 540 nt7.41□□□□□ -1.22
NMD2P38798 SPC42YKL042W 1092 nt7.41□□□□□ -1.22
NMD2P38798 RAM1YDL090C 1296 nt7.4□□□□□ -1.22
NMD2P38798 YDR015CYDR015C 240 nt7.4□□□□□ -1.22
NMD2P38798 ISY1YJR050W 708 nt7.4□□□□□ -1.22
NMD2P38798 YNL097W-AYNL097W-A 156 nt7.4□□□□□ -1.22
NMD2P38798 YNL285WYNL285W 372 nt7.4□□□□□ -1.22
NMD2P38798 MUM3YOR298W 1440 nt7.4□□□□□ -1.22
NMD2P38798 MMR1YLR190W 1476 nt7.4□□□□□ -1.22
NMD2P38798 MKC7YDR144C 1791 nt7.4□□□□□ -1.23
NMD2P38798 SOH1YGL127C 384 nt7.39□□□□□ -1.23
NMD2P38798 GTO1YGR154C 1071 nt7.39□□□□□ -1.23
NMD2P38798 RSA4YCR072C 1548 nt7.38□□□□□ -1.23
NMD2P38798 LPL1YOR059C 1353 nt7.38□□□□□ -1.23
NMD2P38798 YDL218WYDL218W 954 nt7.38□□□□□ -1.23
NMD2P38798 NAT5YOR253W 531 nt7.38□□□□□ -1.23
NMD2P38798 DAP1YPL170W 459 nt7.38□□□□□ -1.23
NMD2P38798 YDR132CYDR132C 1488 nt7.37□□□□□ -1.23
NMD2P38798 YER147C-AYER147C-A 411 nt7.37□□□□□ -1.23
NMD2P38798 YGL235WYGL235W 537 nt7.37□□□□□ -1.23
NMD2P38798 SPO12YHR152W 522 nt7.37□□□□□ -1.23
NMD2P38798 MTF1YMR228W 1026 nt7.37□□□□□ -1.23
NMD2P38798 RRS1YOR294W 612 nt7.37□□□□□ -1.23
NMD2P38798 SRV2YNL138W 1581 nt7.37□□□□□ -1.23
NMD2P38798 WHI2YOR043W 1461 nt7.36□□□□□ -1.23
NMD2P38798 WTM1YOR230W 1314 nt7.36□□□□□ -1.23
NMD2P38798 ICL1YER065C 1674 nt7.36□□□□□ -1.23
NMD2P38798 MRPL25YGR076C 474 nt7.36□□□□□ -1.23
NMD2P38798 PML1YLR016C 615 nt7.36□□□□□ -1.23
NMD2P38798 QRI5YLR204W 336 nt7.36□□□□□ -1.23
NMD2P38798 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt7.36□□□□□ -1.23
NMD2P38798 DSE3YOR264W 1293 nt7.36□□□□□ -1.23
NMD2P38798 CSC1YLR241W 2349 nt7.36□□□□□ -1.23
NMD2P38798 ASN1YPR145W 1719 nt7.35□□□□□ -1.23
NMD2P38798 PCL6YER059W 1263 nt7.35□□□□□ -1.23
NMD2P38798 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt7.35□□□□□ -1.23
NMD2P38798 CAF40YNL288W 1122 nt7.35□□□□□ -1.23
NMD2P38798 GUD1YDL238C 1470 nt7.35□□□□□ -1.23
NMD2P38798 RGD1YBR260C 2001 nt7.34□□□□□ -1.23
NMD2P38798 MRPL1YDR116C 858 nt7.34□□□□□ -1.23
NMD2P38798 ICS3YJL077C 396 nt7.34□□□□□ -1.23
NMD2P38798 LDS1YAL018C 978 nt7.34□□□□□ -1.23
NMD2P38798 AVO1YOL078W 3531 nt7.34□□□□□ -1.24
NMD2P38798 NHA1YLR138W 2958 nt7.33□□□□□ -1.24
NMD2P38798 MDM31YHR194W 1740 nt7.33□□□□□ -1.24
NMD2P38798 UTP9YHR196W 1728 nt7.33□□□□□ -1.24
NMD2P38798 URA7YBL039C 1740 nt7.33□□□□□ -1.24
NMD2P38798 SPG1YGR236C 288 nt7.33□□□□□ -1.24
NMD2P38798 DOT5YIL010W 648 nt7.33□□□□□ -1.24
NMD2P38798 YIL077CYIL077C 963 nt7.33□□□□□ -1.24
NMD2P38798 JNM1YMR294W 1122 nt7.33□□□□□ -1.24
NMD2P38798 GAT1YFL021W 1533 nt7.32□□□□□ -1.24
NMD2P38798 YEL020CYEL020C 1683 nt7.32□□□□□ -1.24
NMD2P38798 YEL068CYEL068C 333 nt7.32□□□□□ -1.24
NMD2P38798 TSA1YML028W 591 nt7.32□□□□□ -1.24
NMD2P38798 IMA2YOL157C 1770 nt7.32□□□□□ -1.24
NMD2P38798 RMD9YGL107C 1941 nt7.32□□□□□ -1.24
NMD2P38798 PDR18YNR070W 4002 nt7.31□□□□□ -1.24
NMD2P38798 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt7.31□□□□□ -1.24
NMD2P38798 YMR135W-AYMR135W-A 534 nt7.31□□□□□ -1.24
NMD2P38798 YDR387CYDR387C 1668 nt7.31□□□□□ -1.24
NMD2P38798 PIC2YER053C 903 nt7.3□□□□□ -1.24
NMD2P38798 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt7.3□□□□□ -1.24
NMD2P38798 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt7.3□□□□□ -1.24
NMD2P38798 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt7.3□□□□□ -1.24
NMD2P38798 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt7.3□□□□□ -1.24
NMD2P38798 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt7.3□□□□□ -1.24
NMD2P38798 RPS5YJR123W 678 nt7.3□□□□□ -1.24
NMD2P38798 MRPS16YPL013C 366 nt7.3□□□□□ -1.24
NMD2P38798 PFK2YMR205C 2880 nt7.3□□□□□ -1.24
NMD2P38798 YLH47YPR125W 1365 nt7.3□□□□□ -1.24
NMD2P38798 TIM22YDL217C 624 nt7.29□□□□□ -1.24
NMD2P38798 MMS2YGL087C 414 nt7.29□□□□□ -1.24
NMD2P38798 PRE3YJL001W 648 nt7.29□□□□□ -1.24
NMD2P38798 YBL081WYBL081W 1107 nt7.29□□□□□ -1.24
NMD2P38798 HST3YOR025W 1344 nt7.28□□□□□ -1.24
NMD2P38798 BCY1YIL033C 1251 nt7.28□□□□□ -1.24
NMD2P38798 MOG1YJR074W 657 nt7.28□□□□□ -1.24
NMD2P38798 YOL035CYOL035C 303 nt7.28□□□□□ -1.24
NMD2P38798 RPS28AYOR167C 204 nt7.28□□□□□ -1.24
NMD2P38798 YPR114WYPR114W 948 nt7.28□□□□□ -1.24
NMD2P38798 PEX32YBR168W 1242 nt7.28□□□□□ -1.24
NMD2P38798 SAC6YDR129C 1929 nt7.28□□□□□ -1.24
NMD2P38798 HIS7YBR248C 1659 nt7.28□□□□□ -1.24
NMD2P38798 CLD1YGR110W 1338 nt7.27□□□□□ -1.24
NMD2P38798 GPI11YDR302W 660 nt7.27□□□□□ -1.25
NMD2P38798 AAD6YFL056C 639 nt7.27□□□□□ -1.25
NMD2P38798 YHR095WYHR095W 495 nt7.27□□□□□ -1.25
NMD2P38798 ZRT2YLR130C 1269 nt7.27□□□□□ -1.25
NMD2P38798 YML083CYML083C 1257 nt7.27□□□□□ -1.25
NMD2P38798 KKQ8YKL168C 2175 nt7.27□□□□□ -1.25
NMD2P38798 SKN1YGR143W 2316 nt7.27□□□□□ -1.25
NMD2P38798 QNS1YHR074W 2145 nt7.27□□□□□ -1.25
NMD2P38798 QRI1YDL103C 1434 nt7.27□□□□□ -1.25
NMD2P38798 TEP1YNL128W 1305 nt7.27□□□□□ -1.25
NMD2P38798 RPT3YDR394W 1287 nt7.26□□□□□ -1.25
NMD2P38798 CIS3YJL158C 684 nt7.26□□□□□ -1.25
NMD2P38798 SNN1YNL086W 309 nt7.26□□□□□ -1.25
NMD2P38798 NPT1YOR209C 1290 nt7.26□□□□□ -1.25
NMD2P38798 LDB19YOR322C 2457 nt7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 588.9 ms